Яндекс.Метрика Долгое прощание с лысенковщиной

Каждый слышит то, что понимает. Гете


"Люди перестают мыслить, когда перестают читать"
.
Д. Дидро


Статистика посещаемости БИОМЕТРИКИ Яндекс
цитирования
Индекс цитирования

Пишите нам на адрес

Выбрав любое изображение, кликните по нему мышкой, и Вы узнаете о статистике ...


Редактор БИОМЕТРИКИ
В. Леонов

 

ПОЛОВИНУ ОТКРЫТЫХ НАУЧНЫХ ЖУРНАЛОВ НАЗВАЛИ «МУСОРОМ»

25 наиболее популярных ссылок, посещаемых нашими читателями
http://www.biometrica.tomsk.ru/Leonov_Erevan_2015.pdf
http://www.biometrica.tomsk.ru/erevan_8.html
http://www.biometrica.tomsk.ru/student.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/UNESCO%202010.pdf
http://www.biometrica.tomsk.ru/zakaz.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/zakaz_28.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/kk.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/erevan_3.html
http://www.biometrica.tomsk.ru/stat_cardio1.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/error.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/STAT_CARDIO_2014.pdf
http://www.biometrica.tomsk.ru/logit_9.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/stat_cardio7.htm

http://www.biometrica.tomsk.ru/potencial.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/zakaz_19.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/erevan_8.html
http://www.biometrica.tomsk.ru/kamchat.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/biometrica_15.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/zakaz_15.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/ftp/dict/cult/gramm.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/biometrica_15.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/stat_cardio5.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/krasnojarsk.htm http://www.biometrica.tomsk.ru/erevan_3.html
http://www.biometrica.tomsk.ru/logit_6.htm



Примеры отличных диссертаций и статей по медицине и биологии, с нашими результатами статистического анализа
В.В. Половинкин. ТОТАЛЬНАЯ МЕЗОРЕКТУМЭКТОМИЯ — ФАКТОР ПОВЫШЕНИЯ ЭФФЕКТИВНОСТИ ЛЕЧЕНИЯ СРЕДНЕАМПУЛЯРНОГО И НИЖНЕАМПУЛЯРНОГО РАКА ПРЯМОЙ КИШКИ.

Н.Г. Веселовская. 
КЛИНИЧЕСКОЕ И ПРОГНОСТИЧЕСКОЕ ЗНАЧЕНИЕ ЭПИКАРДИАЛЬНОГО ОЖИРЕНИЯ У ПАЦИЕНТОВ ВЫСОКОГО СЕРДЕЧНО-СОСУДИСТОГО РИСКА.

О.Я. Васильцева.
ЗАКОНОМЕРНОСТИ ВОЗНИКНОВЕНИЯ, КЛИНИЧЕСКОГО ТЕЧЕНИЯ И ИСХОДОВ ТРОМБОЭМБОЛИИ ЛЕГОЧНОЙ АРТЕРИИ ПО ДАННЫМ ГОСПИТАЛЬНОГО РЕГИСТРА ПАТОЛОГИИ.

В.А. Габышев. 
ФИТОПЛАНКТОН КРУПНЫХ РЕК ЯКУТИИ И СОПРЕДЕЛЬНЫХ ТЕРРИТОРИЙ ВОСТОЧНОЙ СИБИРИ.

М.И. Антоненко.
  ГИПЕРКОРТИЦИЗМ БЕЗ СПЕЦИФИЧЕСКИХ КЛИНИЧЕСКИХ СИМПТОМОВ: ЭПИДЕМИОЛОГИЯ, КЛИНИКА, ДИАГНОСТИКА.

Н.Г. Веселовская
"ПРОГНОЗИРОВАНИЕ РИСКА РЕСТЕНОЗА КОРОНАРНЫХ АРТЕРИЙ ПОСЛЕ ИХ СТЕНТИРОВАНИЯ У ПАЦИЕНТОВ С ОЖИРЕНИЕМ"

ОТЗЫВ врача-кардиолога М.В. Емельяненко, ФКУ «Центральный военный госпиталь имени П.В. Мандрыка» МО РФ, Москва, о проведённом статистическом анализе.  Хочу выразить глубокую признательность за качественный и весьма объёмный труд, проделанный Вами по статистическому анализу моей базы данных. Особенную благодарность, без сомнения, хотелось бы выразить руководителю проекта «БИОМЕТРИКА» - Василию Петровичу Леонову. Причина такой благодарности следующая. Помимо структурированного статистического анализа присланных в Ваш адрес медицинских данных, Вы подробно и, что самое невероятное,  – доступным образом разъяснили мне суть каждого метода, который был применён при анализе моей матрицы. (далее...)

ОТЗЫВ Ахметова А., (Казахстан), о сотрудничестве с БИОМЕТРИКОЙ. Когда я взялся за написание диссертации, то вначале я пытался самостоятельно выполнить статистический анализ собранных мною данных. Для этого пробовал использовать EXCEL и STATISTICA. Однако по мере расширения набора используемых методов анализа, всё яснее стал осознавать, что я не понимаю как сами методы, так и получаемые результаты. Чтобы лучше в этом разобраться, стал очень часто посещать сайт БИОМЕТРИКА. Иногда ежедневно по 2-3 часа читал на этом сайте разные статьи. Особенно полезными были обзоры по Кузбассу, по кардиологии, а также статья "Долгое прощание с лысенковщиной". (далее...)"

Новые полезные книги...

(Заказать книгу можно через издательство)

Ланг Т., Сесик М. Как описывать статистику в медицине. Руководство для авторов, редакторов и рецензентов. Пер. с англ. В.П. Леонова. 2016 - 480 с. Актуальность этого издания весьма велика. По-прежнему в биомедицинских статьях и диссертациях публикуется масса статистических нелепостей, как образцы "статистического самоудовлетворения" и "статистического макияжа". Например, в двух диссертациях, выполненных в 2014 и 2015 гг. в Алтайском медуниверситете по разным специальностям, но при этом в полностью идентичных описаниях, состоящих из 94 слов, написано следующее. «Полученные данные были статистически обработаны с использованием программ Microsoft Offis Exel 2007. Достоверность различий между средними величинами определяли с помощью критерия значимости Стьюдента (t). Нормальность распределений в группах оценивали по критерию Шапиро-Уилка». Далее сообщается об использовании критерия Манна-Уитни, и т.д. Очевидно, что под Offis Exel авторы подразумевали Office Excel. Сложнее было бы об этом догадаться, если бы авторы написали Offis Exul. Вывод: оба диссертанта, как и члены двух диссертационных советов, не знают многого, в том числе описанного в этой книге. Например, не знают того, что в пакете Office Excel нет критериев Шапиро-Уилка и Манна-Уитни. Данная книга обучит правильно и хорошо описывать и понимать результаты статистического анализа. Поэтому исследователи станут более качественно выполнять статистический анализ, получая правильную технологию лечения пациентов. Что в результате будет снижать смертность населения, а также себестоимость лечебных процедур.

  Приложение к русскому изданию книги «Как описывать статистику в медицине. Руководство для авторов, редакторов и рецензентов».
Авторы: Т. А. Ланг, М. Сесик. Перевод с англ. под ред. Леонова В.П. Изд-во:
Практическая Медицина, 2016.
  В приложении приведён список 209 полезных изданий по использованию статистики в биомедицине.

Петри А., Сэбин К. Наглядная медицинская статистика. Учебное пособие. 3-е издание. Пер. с англ. В.П. Леонова. 2015. - 216 с. Предыдущие издания оригинала этой книги были опубликованы в 2000, 2005 и 2009 гг. Третье издание книги, как и два предыдущих, имеет целью донести до читателя основные понятия и принципы медицинской статистики, которые достаточно широко используются зарубежными медиками и биологами. Книга содержит необходимую теоретическую часть, а также в доступной форме даёт практическое описание того, как могут применяться статистические методы в реальных клинических исследованиях. Низкий уровень использования статистики в отечественной медицинской науке является одной из основных причин, по которым уже 111 лет Нобелевские премии по медицине не присуждаются россиянам. Ценность этой книги для медицинской науки определяется и проводимой в России реформой отечественной науки, в том числе реформой ВАК и системы научной аттестации. Учебное пособие предназначено для студентов, аспирантов и докторантов медицинских вузов, биологических факультетов университетов, врачей, исследователей-клиницистов и всех, кто является сторонником доказательной медицины.

Банержи А. Медицинская статистика понятным языком: вводный курс. Издательство "Практическая медицина", 2014. - 287 с. Пер. с англ. В.П. Леонова.
Издание представляет собой вводный курс по принципам статистики. Представлены базовые понятия и принципы статистических исследований применительно к медицине. В отличие от большинства подобных изданий, указанные темы изложены кратко и доступно. Для чтения книги не требуется знание сложных разделов высшей математики, вполне достаточно тех, что даются в школе. Внедрение в практику принципов доказательной медицины диктует необходимость понимания статистики. После знакомства с книгой читатель сможет критически оценивать многочисленные публикации, содержащие статистическую терминологию и результаты описанных исследований. Полученные знания помогут избежать ошибок в планировании биомедицинских исследований, а также в изложении их результатов. Большим преимуществом книги служат глоссарий и подробный предметный указатель.
Для студентов, аспирантов, научных работников, а также врачей всех специальностей.

Доклад "Почему и как надо учить медиков статистике?" В. Леонов.

Зачем нужна статистика в доказательной медицине?  В. Леонов. Армянский медицинский реферативный журнал, 2012, вып. 9, с. 184-193.

Центр БИОСТАТИСТИКА выполняет работы по статистическому анализу экспериментальных данных уже более 30 лет. В его составе исследователи России, США, Израиля, Англии, Канады и других стран. Услугами Центра пользуются аспиранты и докторанты в области медицины, биологии, социологии, психологии и т.д. (См. далее )



Долгое прощание с лысенковщиной 

Результаты аналогичных исследований других авторов

Нам неизвестны аналогичные ни отечественные, ни зарубежные исследования, выполненные на материале диссертаций и монографий в области медицины и биологии. Однако исследования на материале журнальных публикаций периодически проводятся как отечественными, так и зарубежными авторами. Ниже мы приведем результаты нескольких подобных отечественных исследований. Так, достаточно известны два детальных исследования журнальных статей, инициированные известным российским статистиком, философом и методологом науки профессором МГУ В.В. Налимовым. Результаты первого из этих исследований были опубликованы в [69]. В работе изучалось состояние математизации в психиатрии. Авторы обсудили содержание обзора по использованию математических методов в психиатрии, и провели сравнение содержания "Журнал невропатологии и психиатрии им. С.С. Корсакова" за 1979-1981гг. и за 1987г. с 597 статьями, опубликованными в 1980г. в трех ведущих англоязычных психиатрических журналах (АПЖ): American Journal of Psychiatry, British Journal of Psychiatry и Archives of General Psychiatry. Основные результаты этого сравнения приводятся в табл.4. Делается вывод о том, что существенно различаются по степени математизации англоязычные и русскоязычные статьи по психиатрии.

Для иллюстрации этого утверждения мы приводим ниже одну из таблиц данной работы. Приведенные результаты сравнения столь очевидны, что не нуждаются в дополнительных комментариях. Обращает на себя внимание, что для отечественных публикаций структура распределения осталась практически неизменной на протяжении всего периода с 1979 по 1987гг. Отметим, что в группе 4 под "методом Фишера" подразумевается разработанный им дисперсионный анализ (ANOVA), а в группе 8 при наборе видимо была допущена опечатка: вместо "некоррекционными" должно быть "некорреляционными". В пользу этого предположения говорит и тот факт, что в статье [70] в аналогичной таблице авторы использовали слово "некорреляционными".

Таблица 4. Распределение публикаций в психиатрических журналах по годам [69]

Категория статей

Характеристики статей и используемые в них статистические методы

АПЖ

Журнал невропатологии психиатрии им. С.С.Корсакова

    1980 1979 1980 1981 1987
1 Описательные и обзорные сообщения 28 94 101 95 93
2 Краткие сообщения без статистических данных 129 37 50 43 47
3 Описательная статистика: таблица, графики, средние, вариабельность 90 35 45 43 55
4 Хи-квадрат, t-тесты, метод Фишера 236 30 29 38 52
5 Корреляционные методы 94 3 7 7 10
6 Частотный анализ, F-тест 79 1 0 0 1
7 Непараметрические ранговые методы 36 0 0 0 1
8 Измерение связей некоррекционными методами 32 0 1 0 0
9 Регрессионный анализ 25 0 0 0 2
10 Дискриминантный и факторный анализ 17 1 2 1 1
11 Оценки максимальной вероятности, интервальные оценки 5 0 0 0 0
12 Кластер-анализ, классификации 2 0 1 0 1
13 Анализ "выживаемости" 3 0 0 0 0
14 Сериальный и спектральный анализ 3 0 0 0 0
15 Планирование эксперимента: латинские квадраты, иерархические модели 4 0 0 0 0
16 Байесовы методы 1 0 0 0 0

Спустя 6 лет данное исследование было продолжено уже в другом авторском составе и его результаты приведены в [70]. "В настоящее время в России существует уже несколько новых психиатрических журналов, существенно расширился диапазон публикаций, исследовательская психиатрия оснастилась компьютерами, с помощью которых легко использовать пакеты стандартных статистических программ. Можно было ожидать существенного расширения использования математических методов. Проверка этого предположения и стала главной целью настоящего исследования"[70]. Для проведения исследования авторами был выбран журнал "Социальная и клиническая психиатрия" (СКП).

"Главная трудность анализа использования количественных методов в СКП лежит вне математики, в смысловой организации большей части работ, в их семантике. Это, прежде всего - нечеткость формулировки цели и задач, как работы в целом, так и отдельных ее фрагментов, в частности статистических, которые часто даются без какой-либо мотивировки и последующего обсуждения, то есть, используются формально. Последнее, особенно наглядно в тех работах, где существовал раздел "материалы и методы". В этом разделе иногда не было даже упоминаний о методах математической статистики, которые затем появлялись в тексте без какого-либо объяснения. Если же указания на такие методы и были, ни в одной работе не встретилось объяснения, почему выбраны именно эти методы, а не другие, и что с их помощью предполагалось получить"[70]. Результаты этого достаточно глубокого и беспристрастного анализа представлены авторами в виде графика и таблицы, которая приведена ниже.

Таблица 5. Использование статистических методов в публикациях психиатрических журналов [70]

АП ЖК СКП Отличие от АП
Характер методов 1980 1979-1981 и 1987 1991-1995 ЖК

P <

СКП

P <

1 Описательные сообщения и обзоры 157 500 225 0,0001 0,0001
2. Описательная статистика: таблицы, графики, средние, вариабельность 90 178 113 0,0001 0,0001
3. хи-квадрат, t-тесты, метод Фишера 236 149 67 0,0001 0,0001
4. Корреляционные методы 94 27 6 0,0001 0,0001
5. Частотный анализ, F-тест 79 2 1 0,0001 0,0001
6. Непараметрические ранговые методы 36 1 0 0,0001 0,0001
7. Измерение связей некорреляционными методами 32 1 0 0,0001 0,0001
8. Регрессионный анализ 25 2 5 0,0001 0,001
9. Дискриминантный и факторный анализ 17 5 2 0,05 0,05
10. Оценки максимальной вероятности, интервальные оценки 5 0 1 0,01 ____
11. Кластер-анализ, классификации 2 2 0 ------ ------
12. Анализ "выживаемости" 3 0 0 0,05 0,05
13. Сериальный и спектральный анализ 3 0 0 0,05 0,05
14. Планирование эксперимента: латинские квадраты, иерархические модели 4 0 0 0,01 0,05
15. Байесовы методы 1 0 0 ------ ------
16. Всего статей 784 867 420  

АП - англоязычные журналы (Amer. J. Psychiat., Archives Gen. Psychiat.)ЖК - Журнал невропатологии и психиатрии им. С.С.КорсаковаСКП - Социальная и клиническая психиатрия

"Прежде всего, обращает внимание резкое доминирование t-оценок в статьях СКП, которые почти полностью исчерпывают категорию 3 (см. таблицу) в отличие от АП, где широко используется метод хи - квадрат и дискриминантный анализ. Существенно отметить и то, что метод Стьюдента используется в статьях СКП без какого-либо его анализа его приложимости. Между тем этот метод разработан для показателей, имеющих нормальное... распределение, тогда как количественные данные некоторых статей показывают, что это условие не выполняется. А это значит, что неприменима не только t-статистика, но также вычисление средней величины... .

Большинство статей, где используется t-статистика, имеет многофакторную структуру. В подавляющей части таких работ предполагалось обнаружить зависимость одного (например, прогноза) или нескольких явлений (например, диагностические группы) от каких-либо нескольких факторов (клинических, лабораторных, социальных и других или от типов течения определенной нозологической формы). Казалось, было очевидным решить эти задачи с помощью многофакторных математических методов, таких, например, как дисперсионный, факторный, дискриминантный, кластерный анализ или множественная регрессия. Однако за редчайшим исключением авторы опираются на t-статистику, иногда умножая ошибки, указанные в пункте "а"[70].

Далее авторы обращают внимание читателей на то, что "...поражает разрыв между трудоемкостью ... исследования и простотой статистической обработки многопараметрических результатов, основанной на t-статистике, которая не вполне адекватна задаче исследования". В качестве иллюстрации этого утверждения приведем пример из нашего исследования, содержащий ссылки всего лишь на две докторские диссертации. Так, в диссертации "Роль гемопоэзининдуцирующего микроокружения в регуляции кроветворения при действии на организм миелоингибирующих факторов. Принципы фармакологической коррекции"(14.00.16 - пат. физиология, 1994г.) автор сообщает "Всего было использовано 1418 мышей-самцов линии СВА и 120 мышей-самцов линии С57В1/6". Однако все выводы построены только на использовании t-критерия Стьюдента без проверки возможности его использования. В другой диссертации "Влияние нарушения кислотно-щелочного равновесия на динамику раннего постреанимационного периода" (14.00.16 - пат. физиология, 1993г.) автор сообщает, что в работе было использовано 692 беспородных крысы и 531 кролик. И вновь все выводы построены только на применении t-критерия Стьюдента без проверки возможности его использования.

Список подобных примеров мог бы занять несколько страниц. Авторы [70] отмечают, что "... большую группу составили работы, в которых статистика или вовсе не использовалась или была представлена только числовой характеристикой некоторых показателей. ... В одной из работ описывается воздействие 9 факторов и 24 возможных исхода для выявления связи между ними. Однако статья не содержит ни количественных данных, ни тем более их статистической обработки. Совершенно ясно, что научная ценность такой работы исчезающе мала - не потому, что ее описательные выводы неверны, но, будучи недоказательными, становятся научным балластом"[70]. В последующем обсуждении результатов исследования авторы приходят к выводу что "компьютеризация исследовательских учреждений в последние годы не повлияла на расширение измерительных или количественных подходов. Как в прошлом веке, в российской психиатрии доминируют описательные, качественные методы"[70].

Продолжая анализ, авторы делают вывод о том, продвижение математических методов в разделы психиатрии будет по сути дела обусловлено экономическими категориями. В качестве аргумента авторы приводят пример с зарубежной психофармакологией. "Это обусловлено, прежде всего, ответственностью ее практических решений, а также дороговизной ее производства и конкуренцией на рынке сбыта. Жёсткость всех этих отношений заставила психофармакологов насытить математикой не только теоретический, но и прикладной раздел этой дисциплины (клиническое испытание новых препаратов). Почти тотальное обеспечение психофармакологии математикой стало одним из способов повышения ее эффективности и минимизации неудач. ...

Анализ литературы, предпринятый в настоящей работе, свидетельствует, что аналогичная задача еще не возникла перед российской психиатрией в середине 1990-х гг. Более того, часть российских статей по изучению эффективности психотропных препаратов или их сравнительному изучению, даже содержащие количественные данные, обходятся без статистического анализа, лишь изредка используется t-статистика"[70]. В качестве примера подобной работы мы можем привести докторскую диссертацию "Хронобиологические основы нейротропных эффектов солей лития", 14.00.17 - нормальная физиология, 14.00.25 - фармакология, 1997г. В диссертации приведено 34 таблицы содержащих порядка 1000 выражений "M ± m" и "р < 0,05", полученных с помощью t-критерия Стьюдента без проверки условий возможности его использования. В этой же работе проверялись гипотезы о равенстве средних с помощью критерия Стьюдента для признака, который оценивался по 4-х балльной системе.

Подобные же результаты сравнения российских и англоязычных публикаций получены и авторами [71], где сообщены выводы наукометрического анализа статей журналов "ECOLOGY" и "ЭКОЛОГИЯ". Результаты анализа основаны на данных об индивидуальной и совместной частоте встречаемости в этих публикациях экологических и математических терминов. Некоторые результаты этой работы приведены ниже в табл.6.

Таблица 6. Доля публикаций, использующих разные группы математических методов (в % от числа статей из данного журнала) [71]

Математические методы Журнал

"ECOLOGY"

Журнал

"ЭКОЛОГИЯ"

Описательные и обзорные сообщения без статистических данных 4 24
Стандартные методы 77 69
Многомерные методы 60 13
Непараметрические методы 35 0
Категоризованные данные 15 0
Марковские процессы 2 0
Дифференциальные уравнения 2 0

Как видно из табл. 5, наблюдается значительное различие в частоте применения многомерных и непараметрических методов статистики в статьях сравниваемых журналов. Многие из перечисленных выше недостатков отмечались ранее и автором [83]. Немало интересного и поучительного относительно ошибок применения статистики в биологии можно найти и в работах известного пропагандиста биометрии Александра Александровича Любищева, который выделил две группы ошибок: "Ошибки от недостатка осведомленности" и "Ошибки, связанные с избытком энтузиазма"[72-74].

 
[Назад] [Оглавление] [Вперед]

Архив статьи "Долгое прощание с лысенковщиной"

1997 - 2017.© Василий Леонов. E-mail:

Доказательная или сомнительная? Медицинская наука Кузбасса: статистические аспекты.

Отклики читателей статьи "Доказательная или сомнительная?"

Возврат на главную страницу.

Возврат в КУНСТКАМЕРУ

Т. Кун "Структура научных революций"