Яндекс.Метрика Долгое прощание с лысенковщиной

Каждый слышит то, что понимает. Гете


"Люди перестают мыслить, когда перестают читать"
.
Д. Дидро


Статистика посещаемости БИОМЕТРИКИ Яндекс
цитирования
Индекс цитирования

Пишите нам на адрес

Выбрав любое изображение, кликните по нему мышкой, и Вы узнаете о статистике ...


Редактор БИОМЕТРИКИ
В. Леонов

 

ПОЛОВИНУ ОТКРЫТЫХ НАУЧНЫХ ЖУРНАЛОВ НАЗВАЛИ «МУСОРОМ»

25 наиболее популярных ссылок, посещаемых нашими читателями
http://www.biometrica.tomsk.ru/Leonov_Erevan_2015.pdf
http://www.biometrica.tomsk.ru/erevan_8.html
http://www.biometrica.tomsk.ru/student.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/UNESCO%202010.pdf
http://www.biometrica.tomsk.ru/zakaz.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/zakaz_28.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/kk.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/erevan_3.html
http://www.biometrica.tomsk.ru/stat_cardio1.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/error.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/STAT_CARDIO_2014.pdf
http://www.biometrica.tomsk.ru/logit_9.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/stat_cardio7.htm

http://www.biometrica.tomsk.ru/potencial.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/zakaz_19.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/erevan_8.html
http://www.biometrica.tomsk.ru/kamchat.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/biometrica_15.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/zakaz_15.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/ftp/dict/cult/gramm.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/biometrica_15.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/stat_cardio5.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/krasnojarsk.htm http://www.biometrica.tomsk.ru/erevan_3.html
http://www.biometrica.tomsk.ru/logit_6.htm



Примеры отличных диссертаций и статей по медицине и биологии, с нашими результатами статистического анализа
В.В. Половинкин. ТОТАЛЬНАЯ МЕЗОРЕКТУМЭКТОМИЯ — ФАКТОР ПОВЫШЕНИЯ ЭФФЕКТИВНОСТИ ЛЕЧЕНИЯ СРЕДНЕАМПУЛЯРНОГО И НИЖНЕАМПУЛЯРНОГО РАКА ПРЯМОЙ КИШКИ.

Н.Г. Веселовская. 
КЛИНИЧЕСКОЕ И ПРОГНОСТИЧЕСКОЕ ЗНАЧЕНИЕ ЭПИКАРДИАЛЬНОГО ОЖИРЕНИЯ У ПАЦИЕНТОВ ВЫСОКОГО СЕРДЕЧНО-СОСУДИСТОГО РИСКА.

О.Я. Васильцева.
ЗАКОНОМЕРНОСТИ ВОЗНИКНОВЕНИЯ, КЛИНИЧЕСКОГО ТЕЧЕНИЯ И ИСХОДОВ ТРОМБОЭМБОЛИИ ЛЕГОЧНОЙ АРТЕРИИ ПО ДАННЫМ ГОСПИТАЛЬНОГО РЕГИСТРА ПАТОЛОГИИ.

В.А. Габышев. 
ФИТОПЛАНКТОН КРУПНЫХ РЕК ЯКУТИИ И СОПРЕДЕЛЬНЫХ ТЕРРИТОРИЙ ВОСТОЧНОЙ СИБИРИ.

М.И. Антоненко.
 
ГИПЕРКОРТИЦИЗМ БЕЗ СПЕЦИФИЧЕСКИХ КЛИНИЧЕСКИХ СИМПТОМОВ: ЭПИДЕМИОЛОГИЯ, КЛИНИКА, ДИАГНОСТИКА.

Н.Г. Веселовская
"ПРОГНОЗИРОВАНИЕ РИСКА РЕСТЕНОЗА КОРОНАРНЫХ АРТЕРИЙ ПОСЛЕ ИХ СТЕНТИРОВАНИЯ У ПАЦИЕНТОВ С ОЖИРЕНИЕМ"

ОТЗЫВ врача-кардиолога М.В. Емельяненко, ФКУ «Центральный военный госпиталь имени П.В. Мандрыка» МО РФ, Москва, о проведённом статистическом анализе.  Хочу выразить глубокую признательность за качественный и весьма объёмный труд, проделанный Вами по статистическому анализу моей базы данных. Особенную благодарность, без сомнения, хотелось бы выразить руководителю проекта «БИОМЕТРИКА» - Василию Петровичу Леонову. Причина такой благодарности следующая. Помимо структурированного статистического анализа присланных в Ваш адрес медицинских данных, Вы подробно и, что самое невероятное,  – доступным образом разъяснили мне суть каждого метода, который был применён при анализе моей матрицы. (далее...)

ОТЗЫВ Ахметова А., (Казахстан), о сотрудничестве с БИОМЕТРИКОЙ. Когда я взялся за написание диссертации, то вначале я пытался самостоятельно выполнить статистический анализ собранных мною данных. Для этого пробовал использовать EXCEL и STATISTICA. Однако по мере расширения набора используемых методов анализа, всё яснее стал осознавать, что я не понимаю как сами методы, так и получаемые результаты. Чтобы лучше в этом разобраться, стал очень часто посещать сайт БИОМЕТРИКА. Иногда ежедневно по 2-3 часа читал на этом сайте разные статьи. Особенно полезными были обзоры по Кузбассу, по кардиологии, а также статья "Долгое прощание с лысенковщиной". (далее...)"

Новые полезные книги...

(Заказать книгу можно через издательство)

Ланг Т., Сесик М. Как описывать статистику в медицине. Руководство для авторов, редакторов и рецензентов. Пер. с англ. В.П. Леонова. 2016 - 480 с. Актуальность этого издания весьма велика. По-прежнему в биомедицинских статьях и диссертациях публикуется масса статистических нелепостей, как образцы "статистического самоудовлетворения" и "статистического макияжа". Например, в двух диссертациях, выполненных в 2014 и 2015 гг. в Алтайском медуниверситете по разным специальностям, но при этом в полностью идентичных описаниях, состоящих из 94 слов, написано следующее. «Полученные данные были статистически обработаны с использованием программ Microsoft Offis Exel 2007. Достоверность различий между средними величинами определяли с помощью критерия значимости Стьюдента (t). Нормальность распределений в группах оценивали по критерию Шапиро-Уилка». Далее сообщается об использовании критерия Манна-Уитни, и т.д. Очевидно, что под Offis Exel авторы подразумевали Office Excel. Сложнее было бы об этом догадаться, если бы авторы написали Offis Exul. Вывод: оба диссертанта, как и члены двух диссертационных советов, не знают многого, в том числе описанного в этой книге. Например, не знают того, что в пакете Office Excel нет критериев Шапиро-Уилка и Манна-Уитни. Данная книга обучит правильно и хорошо описывать и понимать результаты статистического анализа. Поэтому исследователи станут более качественно выполнять статистический анализ, получая правильную технологию лечения пациентов. Что в результате будет снижать смертность населения, а также себестоимость лечебных процедур.

  Приложение к русскому изданию книги «Как описывать статистику в медицине. Руководство для авторов, редакторов и рецензентов».
Авторы: Т. А. Ланг, М. Сесик. Перевод с англ. под ред. Леонова В.П. Изд-во:
Практическая Медицина, 2016.
  В приложении приведён список 209 полезных изданий по использованию статистики в биомедицине.

Петри А., Сэбин К. Наглядная медицинская статистика. Учебное пособие. 3-е издание. Пер. с англ. В.П. Леонова. 2015. - 216 с. Предыдущие издания оригинала этой книги были опубликованы в 2000, 2005 и 2009 гг. Третье издание книги, как и два предыдущих, имеет целью донести до читателя основные понятия и принципы медицинской статистики, которые достаточно широко используются зарубежными медиками и биологами. Книга содержит необходимую теоретическую часть, а также в доступной форме даёт практическое описание того, как могут применяться статистические методы в реальных клинических исследованиях. Низкий уровень использования статистики в отечественной медицинской науке является одной из основных причин, по которым уже 111 лет Нобелевские премии по медицине не присуждаются россиянам. Ценность этой книги для медицинской науки определяется и проводимой в России реформой отечественной науки, в том числе реформой ВАК и системы научной аттестации. Учебное пособие предназначено для студентов, аспирантов и докторантов медицинских вузов, биологических факультетов университетов, врачей, исследователей-клиницистов и всех, кто является сторонником доказательной медицины.

Банержи А. Медицинская статистика понятным языком: вводный курс. Издательство "Практическая медицина", 2014. - 287 с. Пер. с англ. В.П. Леонова.
Издание представляет собой вводный курс по принципам статистики. Представлены базовые понятия и принципы статистических исследований применительно к медицине. В отличие от большинства подобных изданий, указанные темы изложены кратко и доступно. Для чтения книги не требуется знание сложных разделов высшей математики, вполне достаточно тех, что даются в школе. Внедрение в практику принципов доказательной медицины диктует необходимость понимания статистики. После знакомства с книгой читатель сможет критически оценивать многочисленные публикации, содержащие статистическую терминологию и результаты описанных исследований. Полученные знания помогут избежать ошибок в планировании биомедицинских исследований, а также в изложении их результатов. Большим преимуществом книги служат глоссарий и подробный предметный указатель.
Для студентов, аспирантов, научных работников, а также врачей всех специальностей.

Доклад "Почему и как надо учить медиков статистике?" В. Леонов.

Зачем нужна статистика в доказательной медицине?  В. Леонов. Армянский медицинский реферативный журнал, 2012, вып. 9, с. 184-193.

Центр БИОСТАТИСТИКА выполняет работы по статистическому анализу экспериментальных данных уже более 30 лет. В его составе исследователи России, США, Израиля, Англии, Канады и других стран. Услугами Центра пользуются аспиранты и докторанты в области медицины, биологии, социологии, психологии и т.д. (См. далее )



Долгое прощание с лысенковщиной 

Типология описания использованных методов

Оставшаяся часть работ содержит в той или иной форме описание использованных методов статистики. В большинстве таких работ методы статистики упоминаются в разделе (главе) "Материал и методы". В большинстве проанализированных работ описание статистических методов и критериев дается в форме шаблонных клише с весьма расплывчатым содержанием.

Можно выделить три группы подобных клише. В первой группе с разными вариациями просто констатируется сам факт использования статистических методов. Доля этой группы, по отношению ко всем работам содержащим описания, составляет примерно 45%. Для нее характерны следующие описания:

1. Результаты обработаны статистически.

2. Обработку данных проводили статистическими методами.

3. Результаты обработаны методом (методами) вариационной статистики (варианты: стандартными программами, общепринятыми методами и т.п.).

4. Результаты подвергнуты статистической обработке.

Приведем наиболее типичные образцы подобных описаний: "Полученные данные обработаны статистически" ("Вестник РАМН", 1995г., №2, стр.18), "Результаты опытов обработаны статистически общепринятым способом, различие считали при уровне вероятности не менее 95%" (БЭБМ, 1997, вып.8, стр.179), "Количественные данные статистически обрабатывали" (БЭБМ, 1997, вып.9, стр.320), "Полученные данные подвергнуты статистическому анализу" (стр.36 диссертации "Лечение больных инфарктом миокарда в фазу рековалесценции аминазин-электрофорезом", 1992 г.).

Такие же скромно-лаконичные описания мы обнаружили и во многих других диссертациях и монографиях. Изобилуют подобными вербальными орнаментами и многие журнальные статьи. Что подразумевают авторы под стандартными и общепринятыми методами и стандартными программами, читатель может лишь догадываться. Попытайтесь представить аналогичное описание методики лечения: "Больных лечили стандартным (общепринятым) способом...", не упоминая при этом сам стандарт.

Пожалуй, наиболее необычное описание этого важного этапа своего исследования дано в статье "Варьирование активностей цистеиновых катепсинов почек и печени" ("БЭБМ" 1995, №12, стр.586-589): "Математическую обработку проводили обычным способом с использованием компьютера".  Далее в статье авторы нигде не упоминают ни одного конкретного метода статистического анализа и статистического критерия, хотя и используют выражения p<0,05 и 0,01. Если часть авторов удовлетворяется только одним методом вариационной статистики, то другие используют уже методы (несколько).

Например, в статье "Использование эссенциальных фосфолипидов в лечении больных ишемической болезнью сердца и инсулиннезависимым сахарным диабетом" (Кардиология, 1996, N1, стр. 30-33) все описание использованных авторами статистических методов свелось всего лишь к одной фразе (стр.31): "Полученные данные обрабатывали на ЭВМ методами многомерной статистики". Однако далее в тексте авторы видимо забыли об этой фразе и нигде не приводят абсолютно никаких даже намеков на эти самые "многомерные методы". Нет ни только названий этих таинственных методов, но нет и обсуждения результатов их применения. (А был ли мальчик? - В.Л.)

Для второй группы работ (примерно 30%) характерно наличие указаний на более конкретные детали: 1) фамилия автора пособия по статистике; 2) статистический критерий; 3) один или два статистических параметра; 4) тип ЭВМ, персонального компьютера или название пакета программ:

1. Материал обрабатывали статистически по методу Лакина (варианты: по В.Ю.Урбаху; по таблицам Стрелкова).

2. Достоверность значений определяли по t-критерию Стьюдента (варианты: по среднеквадратичному отклонению усредненных значений параметров; методом определения среднего квадратического отклонения от средней величины.

3. Статистическая обработка материала произведена с использованием мини-ЭВМ "Искра-1256" (варианты: IBM PC, IBM PC XT (AT, 386 SX/ 486 и т.п.) по стандартным программам.

Очевидно, что для читателя ссылка на определенную фамилию (Лакин, Урбах, Стрелков) ни о чем не говорит, поскольку в книгах данных авторов описано много разнообразных методов. Что сможет узнать врач, например, о методике лечения больных, если автор статьи или диссертации напишет: "Лечение больным назначалось по Машковскому и Видалю..."? Делать подобную ссылку всё равно, что утверждать наличие методики Машковского или Видаля, только по той причине, что есть лекарственные справочники с такими именами..

Примерно в половине работ, в которых упоминаются конкретные критерии или фамилии (t-Стьюдента, Лакин, Урбах, Стрелков, Каминский, Венчиков, Генес и т.д.) даются ссылки на литературу. В другой же половине работ никаких ссылок не приводится. В случае применения достаточно популярных статистических критериев, например t-критерия Стьюдента, отсутствие подобной ссылки менее критично. Однако когда автор использует менее популярные методы или критерии, такую практику вряд ли можно считать приемлемой.

В некоторых работах авторы просто отмечают сам факт использования вычислительной техники, не конкретизируя ее наименование. Так, например, на 61 стр. диссертации "Оценка динамики развития эффективности лечения и влияние очага некроза на гемодинамику у больных инфарктом миокарда" (1987г.) читаем, что "статистическая обработка проводилась разностным методом, Ойвин И.Н., 1960", однако в списке цитируемой литературы такой автор отсутствует. Поэтому, что это за разностный метод Ойвина, можно только строить предположения.

Во многих диссертациях и статьях дается конкретное наименование используемых средств вычислительной техники. Упоминание типа компьютера вероятно, по мнению авторов, должно поднять в глазах читателей значимость и доверие к полученным выводам, особенно если результаты работы получены с помощью зарубежного компьютера. В более ранних работах упоминаются программируемые микрокалькуляторы, подобно тому, как это сделано на стр.43 диссертации "Желчеотделительная функция печени при аппликациях сапропеля в эксперименте" (1992г.): "Результаты исследований обрабатывали статистически с применением программируемого микрокалькулятора МК-54."

Впрочем, подобные упоминания можно встретить и в относительно свежих работах: "Все полученные цифровые данные подвергались вариационно-статистической обработке на программируемом микрокалькуляторе "Электроника МК 52", используя критерии достоверности по Стьюденту"(стр.56 диссертации "Соматические и психовегетативные соотношения у больных описторхозом", 1995г.).

Достаточно многие авторы выполняли этап статистического анализа, используя такие популярные в свое время средства вычислительной техники, как ЭВМ СМ-4 и мини-ЭВМ "Искра-1256": "Математическая обработка результатов производилась методами вариационной статистики на ЭВМ СМ-4" (стр.42 диссертации "Парамагнитные центры и свободнорадикальное окисление липидов при артериальной гипертонии у строителей БАМ", 1987 г.).

В работах же последних лет все чаще упоминаются персональные компьютеры IBM PC, например:"Полученные результаты обработаны статистически с использованием персонального компьютера IBM PC XT" (стр.50 диссертации "Клинико-конституциональные взаимосвязи при язвенной болезни желудка и двенадцатиперстной кишки", 1996 г.).

При упоминании в данных разделах работ персональных компьютеров авторы чаще всего и ограничивают этим фактом описание методики статистического анализа собственных экспериментальных наблюдений. Вот пример подобного описания: "Полученные результаты обрабатывались статистическими методами вариационной статистики с использованием персонального компьютера типа IBM PC 286" (стр.53 диссертации "Функциональная характеристика эпителиально-гладкомышечных взаимодействий в стенке воздухоносных путей и кровеносных сосудов", 1995 г.).

Авторы подобных работ видимо полагают, что упоминание персонального компьютера является как бы "знаком качества" и тем самым гарантирует достоверность и надежность декларируемых ими статистических выводов. Позиция таких авторов отражает весьма опасный миф, бытующий среди медиков и биологов: "ЭВМ не ошибается", что звучит как "жена Цезаря вне подозрений". Авторы таких работ путают два понятия: надежность персональных компьютеров и их производительность с правильностью полученных на компьютере результатов анализа. А между тем это совершенно разные вещи, поскольку для получения верного результата должны быть выполнены многочисленные условия, которые автору не всегда известны, либо не всегда им проверяются. Отметим, что подобные описания чаще всего характерны для докторских диссертаций, нежели статей и кандидатских диссертаций.

Если часть авторов вполне удовлетворялась упоминанием только одного средства вычислительной техники - микрокалькулятора, ЕС ЭВМ или персонального компьютера, то другие авторы приводят целый список таких средств, нередко совмещая в нем несколько поколений ЭВМ. Вот как выглядит такой список на стр.78 диссертации "Общие закономерности восстановления и механизмы нарушений кровообращения в постреанимационном периоде",1989 г.: "Обработка проводилась на ЭВМ "Наири-2", ЭВМ ЕС-1022, с помощью микрокалькуляторов "Электроника Б3-18А", "Электроника Б3-21". По всей видимости автор счел, что перечисление не одной ЭВМ, а сразу четырех, усилит доверие к полученным им научным выводам.

Очевидно, что информация о типе ЭВМ является излишней и ее не имеет смысла приводить в диссертации или статье. Более же необходимым является достаточно полное упоминание о конкретных статистических методах, критериях, статистических пакетах программ и реализованных в них статистических процедурах. Хотя, применение хорошего пакета программ и не гарантирует правильность полученных при этом результатов, тем не менее, читатель может сопоставить результаты, приведенные в работе со своими собственными результатами, если те и другие были получены с применением одного и того же пакета программ или конкретной процедуры пакета.

Особенно это относится к тем случаям, когда используются развитые системы статистического анализа с собственным языком программирования, например пакет SAS. В таких случаях для понимания авторской логики статистического анализа данных необходимы уже не только наименования используемых процедур, например FACTOR или FASTCLUS, но и используемые в этих процедурах детализирующие их опции. Такие опции уточняют, например, алгоритм включения независимых, предикторных переменных в уравнение регрессии (пошаговый или принудительный), конкретизируют используемую метрику пространства и алгоритм объединения в кластерном анализе, указывают алгоритм вращения осей в факторном анализе и т.д.

Однако, в проанализированных работах указание конкретного типа статистической программы было примерно в 3% работ. Наиболее часто упоминаются пакеты STATGRAPHICS, CSS и SPSS. В последние годы стали появляться ссылки и на популярные электронные таблицы SuperCalc и Microsoft Excel.

Третья группа проанализированных работ (примерно 25%) содержит достаточно безграмотные, а подчас и просто абсурдные либо противоречивые сочетания перечисляемых терминов или критериев. В таких описаниях авторы часто вводят свою собственную терминологию, не раскрывая в тексте работы содержания и смысла используемых терминов. Либо же употребляют известные в статистике термины в иных, не раскрываемых ими значениях.Ниже мы приводим несколько таких выражений взятых в диссертациях и статьях.

1. Доверительный интервал рассчитан для 95% уровня значимости. (?)

2. Подсчёт среднего количества М ± m производили по методу Стьюдента.

3. Статистическую обработку данных осуществляли с помощью t-критерия Стьюдента при Р > 0,05. (?)

4. Статистическую обработку данных производили по методу Стьюдента с применением критерия c2 . (?)

5. Достоверность различий между отдельными контингентами лиц определяли по критерию Фишера.

6. Результаты обрабатывали статистически с определением средней арифметической, стандартной ошибки и доверительного интервала при Р > 0,05. (?)

8. Корреляционный анализ проводили путем сравнения двух групп с помощью критерия t. (?)

Например, невозможно понять смысл выражений типа "Различия считали статистически достоверными при t < 0,05" ("Вестник РАМН", 1995г., №4, стр.14-16) или "Достоверными считали значения коэффициента корреляции, соответствующие 95% уровню значимости" ("Вестник РАМН" 1995г., №12, стр.29). Столь же бессмысленны и следующие фразы: "Достоверным считались отличия с уровнем доверительной вероятности P<0,05" (стр.35 диссертации "Роль поджелудочной железы в регуляции антитрипсиновой и трипсиновой активности крови" (1992г.);" ... на графиках - величины доверительных интервалов при Р=0,05 (стр. 82 диссертации "Роль гемопоэзининдуцирующего микроокружения в регуляции кроветворения при действии на организм миелоингибирующих факторов. Принципы фармакологической коррекции" (1994г.); "Достоверными считали различия с уровнем доверительной вероятности меньше 0,05" (стр. 49 диссертации "Роль трипсина в регуляции моторной функции тонкой кишки" (1992г.).

Подобный стиль описания наиболее характерен для публикаций журналов БЭБМ, "Кардиология" и "Вестник РАМН".  Когда в таких описаниях авторы перечисляют сразу несколько методов или критериев, далее в работе, как правило, при упоминании полученного статистического вывода, обычно приводится только выражение типа "р< 0,05" без указания использованного критерия.

 
[Назад] [Оглавление] [Вперед]

Архив статьи "Долгое прощание с лысенковщиной"

1997 - 2017.© Василий Леонов. E-mail:

Доказательная или сомнительная? Медицинская наука Кузбасса: статистические аспекты.

Отклики читателей статьи "Доказательная или сомнительная?"

Возврат на главную страницу.

Возврат в КУНСТКАМЕРУ

Т. Кун "Структура научных революций"