Яндекс.Метрика СТАТИСТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ДАННЫХ ДЛЯ МЕДИКОВ

Каждый слышит то, что понимает. Гете

Статистика посещаемости БИОМЕТРИКИ

16.05.2011 г. на сайт пришло 2561 человек, открывших 3205 страниц
14.11.2011 г. на сайт пришло 2106 человек, открывших 3250 страниц
14.12.2011 г. на сайт пришло 2640 человек, открывших 3452 страницы
17.01.2012 г. на сайт пришло 2439 человек, открывших 3097 страниц
03.03.2012 г. на сайт пришло 2219 человек, открывших 3019 страниц
30.05.2012 г. на сайт пришло 3512 человек, открывших 4706 страниц
06.03.2014 г. на сайт пришло 2556 человек, открывших 3179 страниц
08.02.2015 г. на сайт пришло 2341 человек, открывших 2682 страницы

Если приходят, значит полезное находят.
 
Пишите нам на адрес

Выбрав любое изображение, кликните по нему мышкой, и Вы прочитаете о том, как ...

Редактор БИОМЕТРИКИ
В. Леонов

Яндекс
цитирования
Яндекс цитирования
 
25 наиболее популярных ссылок, посещаемых читателями нашего сайта

http://www.biometrica.tomsk.ru/logit_8.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/kuzbass5.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/student.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/kuzbass6.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/erevan_4.html
http://www.biometrica.tomsk.ru/principals.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/kk.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/erevan_3.html
http://www.biometrica.tomsk.ru/stat_cardio1.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/error.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/paradigma.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/index.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/freq1.htm

http://www.biometrica.tomsk.ru/logit_1.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/cluster_3.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/k_s.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/edu_1.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/potencial.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/kuzbass2.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/ftp/dict/cult/gramm.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/biometrica_15.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/stat_cardio5.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/krasnojarsk.htm http://www.biometrica.tomsk.ru/erevan_3.html
http://www.biometrica.tomsk.ru/logit_6.htm

Центр БИОСТАТИСТИКА выполняет работы по статистическому анализу экспериментальных данных уже более 30 лет. В его составе исследователи России, США, Израиля, Англии, Канады и других стран. Услугами Центра пользуются аспиранты и докторанты в области медицины, биологии, социологии, психологии и т.д. (См. далее )



  Отзывы заказчиков по статистическому анализу данных

ТОМСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ
Биолого-почвенный факультет
Кафедра цитологии и генетики
Факультет информатики
Кафедра прикладной информатики

ДОПУСТИТЬ К ЗАЩИТЕ В ГАК
Зав. каф. цитологии и генетики
профессор Стегний В.Н.
Зав. кафедрой прикладной информатики
профессор С.П. Сущенко
18 апреля 2003 г.

Будникова Мария Александровна
АНАЛИЗ ДИНАМИКИ ЧАСТОТЫ И СПЕКТРА АНОМАЛИЙ МИТОЗА, МЕЙОЗА И ЭЛЕМЕНТОВ ПРОДУКТИВНОСТИ Allium cepa L., ВЗЯТОГО ИЗ АГРОПОПУЛЯЦИЙ С РАЗНОЙ АНТРОПОГЕННОЙ НАГРУЗКОЙ
( Дипломная работа )

Научные руководители -
 доцент Пулькина С.В.
доцент Леонов В.П

Дипломная работа защищена
26 марта 2003 г
с оценкой "ОТЛИЧНО"
Председатель ГАК

Автор работы студентка 171 группы
Будникова М.А.

Томск 2003


4. Результаты и обсуждение 

 4.1. Изучение митоза 

В работе исследовался митоз корневой меристемы Allium cepa L. Митоз характеризуется четырьмя последовательно сменяющими  друг  друга стадиями: профаза, метафаза, анафаза, телофаза (Рисунок 3).
 
 

Рисунок 3 - Клетки Allium cepa на разных  стадиях клеточного цикла (увел. 100x10)
1-профаза; 2-метафаза; 3-анафаза; 4-телофаза; 5-интерфаза.

Для оценки митотической активности учитывались клетки на стадии интерфазы, профазы, метафазы,  анафазы и телофазы. Из всех клеток корневой меристемы для оценки частоты и спектра хромосомных аберраций учитывались клетки с нормально протекающими анафазами и  телофазами и клетки с различными нарушениями нормального протекания этих стадий (Рисунок 4). 
 
 

Рисунок 4 - Аномалии митоза Allium cepa (увел. 100x10). 
1- двойной мост;   2 - мост;   3 - забегание хромосомы.

В результате первой серии экспериментов в контрольной и опытных агропопуляциях Allium cepa были определены частоты и спектры хромосомных аберраций в митозе, а также определен митотический индекс. 

Уровень аберрантных клеток в контроле составил 1,58% (таблица 1). Согласно литературным данным, частота хромосомных аномалий в митозе при спонтанном мутагенезе составляет около 2% ( Цитленок С.И. и соавт., 1996; Nichols C., 1941 ). Результаты, полученные в нашем исследовании для агропопуляции Богашово, соответствуют уровню, отмеченному для спонтанного мутагенеза. 
Процент хромосомных аберраций в агропопуляции дер. Копылово  составил 4,47%, что согласуется с литературными данными ( Цитленок С.И. и соавт., 1996 ), и с помощью ДА Краскела-Уоллиса получены статистически значимые отличия по частоте аберраций по сравнению с контролем (р=0,0003). 

 Частота хромосомных аберраций у  Allium cepa в агропопуляции дер. Виленка составила 7,92%, что почти в 4 раза превышает уровень, соответствующий  спонтанному. Полученный результат практически не  отличается от данных, описанных в литературе ( Цитленок С.И. и соавт., 1995, 1996, 1997 ). Уровень хромосомных аномалий в агропопуляции Виленка статистически значимо выше, чем в контрольной агропопуляции. 

Уровень хромосомных аберраций в агропопуляции дер. Иглаковосоставил 3,89%, что сравнительно ниже результатов предыдущих исследований ( Цитленок С.И. и соавт., 1995, 1996, 1997). С помощью ДА Краскела-Уоллиса получены статистически значимые отличия по частоте аберраций по сравнению с контролем (р=0,0003). 

Таким образом, в исследованных опытных популяциях лука уровень хромосомных аберраций статистически значимо превышает спонтанный уровень, и это свидетельствует о том, что популяции были подвергнуты локальному действию факторов, имеющих мутагенную природу. 
Изучена внутрипопуляционная динамика частоты цитогенетических нарушений за 3 года, используя ретроспективный учет (с 1998 по 2000 г.г. для  а/п Богашово, Копылово и Иглаково;  для а/п  Виленка : 1997, 1999-2000 г.г.) (Рисунок 3 в приложении 1). Наблюдается спад уровня цитогенетических аномалий в контроле ( с 3,08% до 1,58%). В агропопуляции Копылово существенных отличий по частоте за 3 года не было (4,69%,  5,33%, 4,47% соответственно). 

 Резкий спад уровня аберраций (с 7,08% до 3,89%) произошел в агропопуляции Иглаково в период с 1999 по 2000 г.г. В агропопуляции Виленка процент хромосомных аномалий в 1997 году составил 6,64% и остается достаточно высоким (7,9%) в 1999-2000 годах. 
Межпопуляционный анализ частоты хромосомных перестроек в период с 1998 по 2000 г.г. показал, что наибольшая частота патологий митоза наблюдалась в агропопуляции Виленка, затем в порядке убывания: в агропопуляции Иглаково (исключение- 2000 г.), Копылово (в 2000 году уровень аномалий выше уровня, отмеченного для агропопуляции Иглаково, 2000) (Рисунок 4 в приложении 1). 
Согласно данным литературы, в условиях загрязнения среды изменяется не только частота, но и спектр хромосомных мутаций ( Бессонова В.П. и соавт., 1996 ). Хотя доля хромосомных аберраций более надежно, чем спектр, регистрирует воздействие антропогенных факторов ( Гундерина Л.С., 1997). 

При цитогенетическом анализе аномалий митоза у Allium cepa были обнаружены следующие типы аберраций: забегания и отставания хромосом, одиночные и двойные хромосомные и хроматидные мосты, фрагменты, К-митозы, микроядра (достаточно редки) и другие нарушения сложного характера: двойные и множественные забегания хромосом,  двойные и множественные мосты, сочетания различных типов аномалий   (Рисунок 4). 

Спектр нарушений митоза  достаточно широк во всех изученных агропопуляциях Allium cepa ( таблица 2). В контрольной  агропопуляции встречаются такие аномалии, как фрагменты, мосты,  забегания (преобладающий тип нарушений) и отставания хромосом, К-митоз,  нарушения сложного характера. 
 

Таблица 1 - Частота хромосомных аберраций и значение митотического индекса в пяти агропопуляциях Allium cepaL.s
 
Агропопуляция
Год
Среднее число проанализированных клеток  на препарат
Частота аномалий митоза,%   M±m
Митотический индекс,% M±m
Богашово
2000
187,9
1,580± 0,31
10,83± 0,02
Копылово
2000
201,2
4,470± 0,81*
7,47± 0,02*
Виленка
2000
167,4
7,916± 0,53*
3,29± 0,13*
Иглаково
2000
194,0
3,890± 0,62*
4,22 ± 0,01*

Примечание -*различия статистически значимы (р<0,05) по сравнению с контролем 

Таблица 2 -Спектр аномалий митоза у Allium cepa L.
Агропопуляция
Фраг
менты
Мосты
Забегания
хромосом
Отстава
ния 
хромосом
К-митоз
Микро
ядра
Комплек
ные 
нарушения
Богашово
2000
15,20 ± 
0,64
11,15 ± 
0,73
43,58 ± 
0,21
8,78 ± 
0,96
5,40 ±
0,56
0
15,54 ± 
0,75
Копылово
2000
12,79 ± 
0,23 *
4,65 ± 
0,16
59,30 ± 
0,68 *
2,33 ± 
0,13
4,65 ±
0,22
0
16,28 ± 
0,16 *
Виленка,
2000
6,87 ± 
0,12 *
7,08 ±
0,18 *
56,08 ± 
0,54 *
2,19 ±
0,10
7,17 ±
0,19 *
1,06 ±
0,86
19,55 ± 
0,42 *
Иглаково,
2000
39,20 ± 
0,33 *
5,96 ± 
0,16
37,35 ±
0,39 *
0,79 ±
0,43
4,11 ±
0,82
0,13 ±
0,13
9,80 ±
0,14 *

 

 

 

 

 

Примечание-*различия статистически значимы (р<0,05) по сравнению с контролем 

Наиболее распространенным типом аберраций во всех изученных агропопуляциях, за исключением агропопуляции Иглаково, являются забегания хромосом (Рисунок 4).  В агропопуляции Иглаково чаще других аномалий встречаются фрагменты. Мосты и фрагменты связаны с нарушением структуры хромосом ( ацентрики и дицентрики ), и данные литературы указывают на то, что такие хромосомные перестройки наиболее часто встречаются при действии физических факторов мутагенеза, в частности, при облучении низкими дозами радиации, т.е. являются маркерами радиоактивного загрязнения (Дубинин Н.П. и др.,1980). Геномные мутации, связанные с нарушением веретена деления (отставания и забегания  ромосом ), характерны для химического мутагенеза ( Гундерина Л.С., 1997 ). Доля фрагментов, забеганий и комплексных нарушений  во всех изученных агропопуляциях статистически значимо отличается от контрольного показателя. Доля мостов и К-митозов в агропопуляции Виленка статистически значимо выше, чем в контроле (таблица 3). 
 

Таблица 3. Значения достигнутого уровня значимости (р), полученные с помощью ДА при сравнении спектра аномалий опытных агропопуляций Allium cepa L. с контрольной
 
Агропопуляция
Фраг
менты
Мосты
Забегания
хромосом
Отстава
ния 
хромосом
К-митоз
Микро
ядра
Комплекс
ные 
нарушения
Виленка-Богашово
0,0099
0,0153
0,0002
 
0,0009
 
0,0005
Иглаково- Богашово
0,0001
 
0,0028
 
 
 
0,0054
Копылово- Богашово
0,0216
 
0,0005
 
 
 
0,0001

Примечание - указаны только статистически значимые отличия по сравниваемым группам.

С помощью проведенного дисперсионного анализа доказано наличие статистически значимых различий ( р<0,05 ) между выборками по общему уровню цитогенетических нарушений в митозе (MUT), а также по числу  следующих хромосомных аберраций: забеганий хромосом, отставаний хромосом, фрагментов, К-митозов, комплексных нарушений. Исследованные выборки имеют также значимые отличия по  количественному содержанию нормальных ана-телофаз на препарат и по общему числу анателофаз на препарат.

Дискриминантный анализ показал, что наибольший вклад в различия между выборками вносит такой признак как MUT (общее число мутантных клеток на популяцию). Затем в порядке убывания идут следующие информативные признаки: число фрагментов на препарат  (FR), число телофаз на 400 клеток препарата (T), число метафаз на 400 клеток препарата (M),  длина корня (LROOT), количество загнутых корней (ZAG), число анафаз на 400 клеток препарата (A), число мостов  на препарат (MO), число отставаний на препарат (OT) (Таблица 4),- их можно рекомендовать использовать в оценке загрязнения окружающей среды. Остальные признаки оказались малоинформативными, поэтому в анализ не включены. 
 
 
Таблица 4 - Стандартизованные коэффициенты дискриминантной функции 
 
 Корень 1
 Корень 2
 Корень 3
MUT
 1,65111
 -0,574108
 0,728741
 FR
 -0,67387
 0,697034
 0,400805
 T
 -0,17661
 -0,53738
 0,709830
 M
 -0,39474
 -0,43306
 0,248471
 LROOT
 -0,79746
 0,384204
 0,026024
 ZAG
 -0,61950
 0,485490
 0,267969
 A
 -1,04980
 -0,124550
 -0,306156
MO
 -0,60441
 0,581185
 -0,546156
 OT
 -0,57633
 -0,228846
 -0,352119

На рисунке 5 показано, что более всего по всем информативным признакам от контроля отдалена агропопуляция Виленка, тогда как агропопуляции Копылово и Иглаково находятся примерно на одном уровне и близки к контрольной выборке. 
 


Рисунок 5 - Распределение наблюдений по каноническим осям (данные по митозу) 

Это подтверждает наши и литературные данные о том, что в агропопуляции Виленка Allium cepa L. имеет самый высокий уровень цитогенетических нарушений в митозе (таблица 1) и статистически значимо отличается от контрольной выборки по общему уровню аномалий. 
Значения митотического индекса представлены в таблице 1. Наибольшее его значение получено для агропопуляции Богашово (10,83%), а наименьшее - для агропопуляции Виленка (3,29%) . С помощью ДА установлено статистически значимое (р < 0,05) снижение митотической активности во всех  опытных агропопуляциях по сравнению с контролем (Рисунки 4-6). 

Результаты соответствуют данным, полученным в предыдущих исследованиях (Цитленок С.И. и соавт., 1997) и указывают на то, что подавление воспроизведения клеток продолжается.   Во всех агропопуляциях отмечено накопление профаз, что свидетельствует в пользу блокады формирования веретена деления.  В целом,  снижение  пролиферативной активности клеток связано с влиянием антропогенных факторов. 
В период с 1998 по 2000 годы во всех исследованных агропопуляциях идет  снижение митотической активности (Рисунок 6), что говорит о постоянно действующих на этих территориях антропогенных  факторах.

Рисунок 6 - Связь между числом профаз на препарат и значением митотического индекса.

В целом, статистическая значимость разницы опытных агропопуляций с контрольной по этому показателю сохраняется и в динамике.

С помощью проведенного корреляционного анализа показано наличие положительной корреляционной связи между значением митотического индекса и числом клеток, вступивших на ту или иную стадиях митоза (Приложение 3), что согласуется с результатами литературных данных (Вострикова Т.В., 2002), т.е. чем больше доля клеток на каждой стадии митоза, тем выше, в целом, митотическая активность. Пример такой положительной связи приведен на рисунке 6. 
В настоящем  исследовании показано наличие отрицательной корреляционной связи (р<0,05) между  величиной  митотического индекса и числом таких цитогенетических аномалий, как к-митоз и микроядра.  С другими нарушениями митоза корреляций выявлено не было. 

Отметим, что существует связь (р<0,05) между величиной митотического индекса и числом нормальных ана-телофаз на препарат (NAT), а также между средним числом ана-телофаз на препарат (SUM) и значением MI. Это, возможно,  позволит рекомендовать учитывать только ана-телофазы, без вычисления митотического индекса для ускорения скрининговых исследований. 
С помощью проведенного дисперсионного анализа показано наличие статистически значимых различий ( р = 0,0000 ) между контрольной и опытными выборками по значению митотического индекса. 

Следовательно, на основе проведенного статистического анализа можно сделать вывод о значимости влияния такого фактора, как место сбора материала на общий уровень цитогенетических нарушений в митозе, на величину митотического индекса и на возникновение в митозе определенных типов аномалий. 
При выполнении логит-регрессионного анализа методом включения переменных по матрице А получены следующие результаты: наибольший вклад в отнесение объекта исследования к той или иной группе (наибольшая вероятность правильного предсказывания градации признака) вносят  такие признаки, как (в порядке убывания значимости): число метафаз, телофаз, анафаз на препарат, общий уровень мутантных клеток. Практически такие же результаты получены при выполнении логит-регрессионного анализа методом исключения входных переменных (Приложение 5). 

Напомним, что дисперсионный анализ также показал наличие статистически значимых отличий между выборками по общему числу аномальных клеток на препарат (Приложение 2 ). 
Оценили соотношение фаз митоза в исследованных выборках (таблица 5  и рисунок 7), и с помощью дисперсионного анализа Краскела-Уоллиса показаны статистически значимые отличия между выборками по среднему числу различных фаз на препарат (Приложение 2). 

Таблица 5 - Соотношение фаз митоза в исследованных агропопуляциях Allium cepa ( в  процентах) >
Агропопуляция
Профаза
Метафаза
Анафаза
Телофаза
Богашово, 2000
65,2
11,2
10,3
13,3
Копылово, 2000
55,9
12,8
10,3
18,6
Виленка, 2000
68,9
8,1
7,7
15,2
Иглаково, 2000
65,2
8,9
7,0
18,8

 
 
 
 
 
 
 
 

 
 
 
 
 

Рисунок 7 - Связь между числом корней на луковицу и уровнем мутантных клеток 

При изучении некоторых биоморфологических показателей лука из разных агропопуляций учитывались следующие из них: максимальная длина пера и максимальная длина корня после 1,5-недельного прорастания луковиц в водопроводной воде, общее количество корней на луковице, число загнутых корней на луковице с целью учета тератогенного эффекта.

В агропопуляции Виленка средняя максимальная длина пера лука составила 19,55 см, в Иглаково - 15,18 см, в Богашово - 13,29 см, в Копылово - 16,07 см, т.е.  наблюдается стимуляция ростового процесса побегов лука, и чем выше уровень техногенного загрязнения агропопуляции, тем  длиннее побег.  С помощью однофакторного дисперсионного анализа Краскела-Уоллиса показаны статистически значимые различия между выборками по длине пера (р = 0,0162) (Приложение 2).  Обратная зависимость получена при измерении максимальной длины корней в исследованных агропопуляциях лука: в контрольной агропопуляции эта величина составила в среднем 5,28 см (Рисунок  8 в приложении 1), в Иглаково - 4,52 см, в Копылово - 3,98 см. Минимальное значение длины корня -  в агропопуляции Виленка (3,71 см). Выборки статистически значимо различаются по длине корня (р = 0,0041) (Приложение 2). Следовательно, мутагенное воздействие на среду ведет к подавлению роста корневой системы лука. Проведенный корреляционный анализ не показал наличие связи между длиной пера и длиной корня. При подсчете общего числа корней на луковицах из контрольной и опытных агропопуляций были получены следующие результаты: максимальное число корней (в среднем 52 корня) наблюдали у луковиц из агропопуляции Иглаково, минимальное - в агропопуляции Виленка (в среднем 17 корней ); в контрольной агропопуляции - в среднем 33 корня, в агропопуляции Копылово -  в среднем 27 корней.   Проведенный корреляционный анализ показал наличие отрицательной связи между общим числом корней на луковицу и общим числом мутаций в митозе ( р = 0,0009) (Приложение 3). На рисунке 7 показан вид этой связи. Проведенный дисперсионный анализ показал, что исследованные агропопуляции статистически значимо различаются между собой по общему числу корней на луковице (р= 0,0001) (Приложение 2). > При подсчете общего числа корней на луковицах из контрольной и опытных агропопуляций считали также число загнутых корней. Данные литературы указывают, что это явный тератогенный эффект, никак не связанный с мутагенным влиянием на популяции растений (Fiskesjo G., 1985). Результаты  корреляционного анализа, проведенного в нашей работе, подтвердили это утверждение, показав отсутствие какой-либо связи между числом  загнутых корней на луковице и уровнем аномалий в митозе.  В контроле процент загнутых корней на луковицу составил 13,6%, в агропопуляции Иглаково - 22,6%, в агропопуляции Копылово - 5,8%,  в агропопуляции Виленка - 23,2%. То есть, такие  количественные показатели, как число корней и длина корней являются более информативными показателями в оценке загрязнения окружающей среды, чем длина побега и число загнутых корней.

 
4.2. Изучение мейоза 

В результате второй серии исследования были определены частота и спектр хромосомных аберраций в мейозе, которые отличаются от показателей, полученных в данном исследовании для митоза. Так, уровень аберрантных хромосом в контроле составил лишь 0,72%. Согласно литературным данным, частота аберрантности хромосом в митозе при спонтанном мутагенезе составляет около 2% ( Цитленок С.И. и соавт., 1996 ). Результаты, полученные в нашем исследовании для популяции Богашово, соответствуют уровню, отмеченному для спонтанного мутагенеза.  >В популяции дер. Копылово (1997) уровень аберрантных хромосом в мейозе составил 5,28%, в Иглаково ( 1997 ) - 2,22%, в Иглаково  ( 2000 ) - 6,03% (Таблица 6 и рисунок 13 в приложении 1).

Таблица 6 - Оценка общего уровня аберраций в мейозе контрольной и  опытных  агропопуляций A. cepa L.
 
Агро-
популяция
Общее число просмотренных
клеток
Общее число клеток на стадии А-Т1
 
Общее число клеток 
на стадии А-Т2
 
 
М±m
(%)
 
нормальных
аномальных
нормальных
аномальных
нормальных
аномальных
 
               
Богашово
10000
7600
2400
0,72±0,31
2000
9929
71
7549
51
2380
20
 
               
Копылово
9627
6144
3483
5,28±1,02
1997
9119
528
5784
360
3335
148
               
Иглаково
10000
6824
3176
2,22±0,83
1997
9778
222
6644
180
3134
42
               
Иглаково
10000
7908
2092
6,03±1,90
2000
9397
603
7429
479
1968
124

Примечание-*различия статистически значимы (р<0,05) по сравнению с контролем

Таким образом, в исследованных опытных популяциях уровень хромосомных аберраций статистически значимо (р < 0,05) превышает уровень, полученный для контрольной агропопуляции, и это свидетельствует о том, что популяции были подвергнуты  локальному действию факторов, имеющих мутагенную природу.

Дисперсионный анализ частот  хромосомных перестроек среди популяций 1997 года (Иглаково, Копылово ) показал, что уровень аномальности хромосом в агропопуляции Копылово ( 5,28% ) статистически значимо выше (р =0,0000), чем в Иглаково ( 2,22%  ) (Приложение 2).
 При проведении дисперсионного анализа по уровню аберраций между агропопуляциями 2000 года ( Богашово и Иглаково ) выяснили, что уровень аберрантности хромосом в Иглаково ( 6,03% ) статистически значимо выше (р =0,0000), чем в Богашово ( 0,72% ) (Приложение 2). 

Сравнивая частоты цитогенетических нарушений митоза и мейоза между собой среди агропопуляций 2000 года, получили следующие результаты (Рисунок 10 в приложении 1): в контроле (Богашово, 2000)  частота аномалий в мейозе (0,72%) ниже, чем в митозе (1,58%); в агропопуляции Иглаково (2000 г.) частота аномалий мейоза (6,03%) оказалась выше, чем в митозе (3,89%). Следовательно, в антропогенно-трансформированной агропопуляции  налицо доказательство того, что мейоз - более чувствительная система к внешним воздействиям, чем митоз.

При цитогенетическом анализе ана- телофаз 1-го и 2-го делений мейоза у Allium cepa были обнаружены следующие типы аберраций: забегания и отставания хромосом, одиночные и двойные хромосомные и хроматидные мосты, множественные мосты, фрагменты ( также в сочетаниях с другими типами аномалий), микроциты в диадах и тетрадах и другие нарушения сложного характера ( комплексные нарушения ) - рисунок 8.


Рис. 8. Спектр цитогенетических нарушений в мейозе 4-х агнопопуляций Allium cepa L.

В контроле ( Таблица 7 ) преобладающим типом хромосомных нарушений явились отставания ( 47,89% ), в Копылово - фрагменты (28,94%), в Иглаково, 1997 - отставания (32,89% ),  в Иглаково, 2000 - мосты ( 26,04% ).

Таблица 7 - Частоты различных типов хромосомных аберраций в мейозе в 
агропопуляциях Allium cepa L.
 
Агро-
Типы аберраций (M±m)
популяция
Отставание
Забегание
Одиночный
Множественные 
Фрагменты
Другие
 
хромосомы
хромосомы
мост
мосты
 
аномалии
Богашово
47,89±1,47
16,90±1,11
12,68±0,56
0,00
22,54±0,51
0,00
2000
 
 
 
 
 
 
Копылово
26,18±0,23
22,64±0,24
15,16±0,81
6,10±0,13
28,94±1,03
0,98±0,10
1997
 
 
 
 
 
 
Иглаково
32,89±0,73
25,23±0,69
11,71±0,21
6,31±0,37
9,46±0,79
14,41±0,13
1997
 
 
 
 
 
 
Иглаково
23,38±0,61
15,09±0,41
26,04±0,24
13,76±0,31
20,90±1,05
0,83±0,18
2000
 
 
 
 
 
 

Более широкий спектр аномалий был установлен у A. cepa из Иглаково 1997, где уровень клеток с комплексными нарушениями составил 14,41% (микроциты, двойные отставания, множественные фрагменты, сочетания разных типов перестроек в одной клетке ), тогда как в других агропопуляциях уровень сложных аберраций не достигал и 5%. Данные литературы свидетельствуют о том, что мультиаберрантные клетки наиболее характерны для воздействия радиации, то есть это типичный радиационный эффект (Ильинских Н.Н. и др., 1992 ).


Мосты и фрагменты связаны с нарушением структуры хромосом (ацентрики и дицентрики ), и данные литературы указывают на то, что такие хромосомные перестройки наиболее часто встречаются при действии физических факторов мутагенеза. Мутации, связанные с нарушением веретена деления ( отставания и забегания хромосом ), характерны для химического мутагенеза ( Иванова О.А., 1974, Гундерина Л.С., 1997 ). 

Проведенный дисперсионный анализ Краскела-Уоллиса  показал наличие статистически значимых различий между исследуемыми агропопуляциями по всем типам цитогенетических нарушений в мейозе. Во всех случаях р < 0,05 (Приложение 2).

С помощью дискриминантного анализа выявили следующие типы информативных признаков, по которым можно легко различить популяции друг от друга: число отставаний во 2-м делении мейоза, число забеганий 1-го и 2-го делений, сложные аберрации в обоих делениях мейоза, число фрагментов  в 1-ом делении мейоза, число мостов во 2-м делении мейоза, количество множественных мостов в обоих делениях мейоза (таблица 8).

Таблица 8 - Стандартизованные коэффициенты дискриминантной функции
 
 
 
Корень1
Корень 2
Корень 3
OT2
0,688135
0,86340
0,056825
ZB1
0,710950
0,40167
-0,709733
DR1
-0,040130
0,47704
0,125625
DR2
0,136335
0,09707
-0,857250
FR1
0,784411
0,05717
0,373659
ZB2
0,653391
0,27619
-0,163796
MO2
-0,183051
-1,22860
0,307641
MNMO2
0,601583
0,51105
-0,150520
NORM
-0,315596
0,36023
0,006698
MNMO1
0,528284
-0,40250
-0,125872

Рисунок 9 - Распределение наблюдений по каноническим осям (данные по мейозу) 

На рисунке 9 показано, что наиболее близко к контролю по результатам переклассификации наблюдений расположена популяция Иглаково, 1997, тогда как две другие отдалены от контроля, но находятся примерно на одном уровне.

Логит-регрессионный анализ показал, что с местообитанием исследуемого объекта теснее  всего связаны такие признаки, как общий уровень мутаций в популяции, затем в порядке убывания значимости: число сложных аномалий во 2-м делении мейоза, число забеганий в 1-ом делении мейоза, число сложных аномалий в 1-м делении мейоза, число множественных мостов  в 1-ом делении мейоза, число мостов  во 2-ом делении мейоза, число фрагментов  в 1-ом делении мейоза, число отставаний в 1-ом делении мейоза,- то есть по этим признакам с наибольшей вероятностью можно отнести объект к той или иной популяции (Приложение 5).

Проведенный корреляционный анализ показал, что существует положительная связь между общим числом мутаций на агропопуляцию и каждым типом аномалий 1-го деления мейоза (р < 0,01). Что касается 2-го деления мейоза, выявлена положительная корреляция между общим уровнем мутаций и количеством забеганий и фрагментов  (р < 0,05) (Приложение 3)

Следует отметить, что в ана- телофазах первого деления процент выявленных аномалий выше, чем во втором делении. Это свидетельствует о том, что мейоз - своеобразный барьер, препятствующий реализации аномалий мейоза в гаметах, что отражено и в изученной  литературе (Константинов А.В., 1971).

По уровню стерильности пыльцы (Рисунок 9) были получены следующие результаты
(рисунок 12): в контроле процент стерильной пыльцы составил 3,68%, в Копылово, 1997  - наибольший процент ( 12,25% ), в Иглаково, 1997 - 6,91%, в Иглаково, 2000 - 10,47%. 

По литературным данным, стерильность пыльцы, в большинстве случаев, связана с нарушением правильности течения мейоза при микроспорогенезе. В некоторых случаях это может привести к стерильности даже 50% всей пыльцы ( Бондарь Л.М., Частоколенко Л.В., 1990 ).  По сравнению с этими данными, уровень стерильной пыльцы, полученный в нашем исследовании, достаточно низок, но, в целом, для популяций это означает уменьшение генетического разнообразия и, как следствие - снижение адаптивных возможностей ( Бессонова В.П. и соавт., 1996 ).

На основании проведенного цитогенетического исследования митоза и мейоза у Allium cepa из агропопуляций с разной антропогенной нагрузкой, можно заключить, что генеративная сфера растений является более чувствительной к воздействию антропогенных и других факторов мутагенеза, чем соматическая. В целом, аномальное протекание мейоза в микроспороцитах и уровень стерильности пыльцы - хорошие прямой и косвенный методы в системе биоиндикации загрязнителей среды, что согласуется с данными других авторов в изученной литературе ( Бондарь Л.М., Частоколенко Л.В., 1990; Бессонова В.П. и соавт., 1996; Giles N.H., Beatty A.V., 1950; Beatty A.V., Beatty J.W.,1955; и др.).

ВЫВОДЫ

1. В исследованных опытных агропопуляциях Allium cepa L. уровень хромосомных аберраций в митозе и в мейозе статистически значимо превышает уровень, полученный для агропопуляции условного контроля. 

2. В спектре хромосомных аберраций выявлены следующие типы нарушений:

а) в митозе: забегания и отставания хромосом, одиночные и двойные хромосомные и хроматидные мосты, множественные мосты, фрагменты, микроядра, К-митозы и другие нарушения сложного характера. 

б) в мейозе: забегания и отставания хромосом, одиночные и двойные хромосомные и хроматидные мосты, множественные мосты, фрагменты (также в сочетаниях с другими типами аномалий), микроциты в диадах и тетрадах и комплексные нарушения.

В контрольной агропопуляции Allium cepa L.  установлено меньшее разнообразие типов хромосомных перестроек по сравнению с антропогенно-трансформированными.

3.     Проведенный корреляционный анализ показал, что существует отрицательная связь между числом корней на луковице и уровнем мутаций, между значением митотического индекса и числом К-митозов и микроядер, между значением митотического индекса и числом клеток на разных стадиях митотического цикла. Положительная корреляция существует между общим уровнем мутантных клеток в мейозе и каждым типом аномалий 1-го деления мейоза (р < 0,01). Что касается 2-го деления мейоза, выявлена положительная корреляция между общим уровнем мутаций и количеством забеганий и фрагментов  (р < 0,05). 

4.   С помощью дисперсионного анализа Краскела-Уоллиса показано, что митотическая  активность клеток корневой меристемы Allium cepa L. в  антропогенно-трасформированных агропопуляциях статистически значимо ниже, чем в контроле. 

5.     В период с 1998 по 2000 годы во всех исследованных агропопуляциях идет  статистически значимое по сравнению с контролем снижение митотической активности, что говорит о постоянно действующих на этих территориях антропогенных  факторах.

6.     Дискриминантный анализ и результаты логистической регрессии показали, что наибольший вклад в различия между выборками вносит общее число мутантных клеток на популяцию. Далее в порядке убывания идут следующие признаки: число фрагментов на препарат , число телофаз на 400 клеток препарата, число метафаз на 400 клеток препарата,  длина корня, количество загнутых корней, число анафаз на 400 клеток препарата, число мостов  на препарат, число отставаний на препарат. Эти признаки можно рекомендовать к использованию на первом этапе скрининговых исследований в оценке уровня загрязнения окружающей среды.

7.   Процент стерильных пыльцевых зерен как в контроле, так и в опыте, оказался невысоким по сравнению с литературными данными.


Список использованной литературы

Абилев С.К., Порошенко Г.Г. Ускоренные методы прогнозирования мутагенных и бластомогенных свойств химических соединений // Итоги науки и техники ВИНИТИ, сер. Токсикология.-1986.-Т.14.-175 с.
Акифьев А.П., Беляев И.Я., Гришанин А.К. Аберрации хромосом, деминуция хроматина и их значение в понимании молекулярно-генетической организации хромосом эукариот // Радиационная  биология. Радиоэкология.- 1996.-Т. 36.- Вып. 6.- С. 789-797.
Алексеев Ю.В. Тяжелые металлы в почвах и растениях. - Л.: Агропромиздат., Ленинградское отделение.-1987.-142с.
Алов И.А. Цитофизиология и патология митоза.- М.: Медицина.- 1972.-183с.
Алтухов Ю.П., Курбатова О.Л. Генетический мониторинг популяций в связи с состоянием среды // XVI Международный генетический конгресс.- М.: Наука.-1987.-С. 8-15.
Балодис В.А.  Некоторые закономерности распределения митозов в кончике корня // Цитология.-1968.-Т.10.-N11.-С.1371-1383.
Белецкий Ю.Д., Наркович А.Н., Дорофеенко Г.Н., Жданов Ю.А. Четвертичные пиридиновые соли как  мутагены//генетика.- 1966.- N7.-С.118-123.
Бессонова В.П., Грицай З.В., Юсыпина И.Ю.  Использование цитогенетических критериев для оценки мутагенности промышленных поллютантов // Цитология и генетика.-1996.-Т.30.-N5.-С.70-76.
Бессонова В.П. Состояние пыльцы как показатель загрязнения среды тяжелыми металлами // Экология.-1992.-Вып.4.-С.45-50.
Бондарь Л.М., Попова О.Н. Генетический анализ действия хронического облучения на природные популяции  Vicia cracca L. // Радиобиология .-1989.- Т.29.-Вып. 3.-С. 310-314.
Бондарь Л.М., Частоколенко Л.В. Микроспорогенез как один из возможных биоиндикаторов загрязняющего воздействия автотрассы // Биологические науки.-1990.-N5.-С.79-84.
Бондарь Л.М., Частоколенко Л.В. и др. Микроспорогенез у Vicia cracca L. из популяций с антропогенным химическим загрязнением // Экология.-1991.-N5.-С.20-24.
Бондарь Л.М., Частоколенко Л.В. Цитогенетические критерии оценки популяций растений в системе генетического мониторинга // Проблемы экологии Томской области.-Томск.-1992.-С.86-88.
Босток К., Самнер Э. Хромосома эукариотической клетки.-М.: Мир.-1981.-600  с.
Бурдин К.С. Основы биологического мониторинга.-М : МГУ.-1985.-160с.
Буторина А.К., Калаев В.Н. Анализ чувствительности различных критериев цитогенетического мониторинга  Zebrina pendula Schnizl.// Экология.- 2000.- N3.- С.206-210.
Буторина А.К., Калаев В.Н. Шкала чувствительности критериев цитогенетического мониторинга //Цитология.-1999.-Т.41.-N 12.-С.1056-1057.
Вайшля О.Б., Лапина Г.В., Москвитина Н.С. Диагностика изменений фотосинтетической функции листьев Betula pendula Roth. в районе северного пром. узла г. Томска // Тз. конференции ЇФундаментальные и прикладные проблемы охраны окружающей среды. Томск: ТГУ.-1995.-С.15.
Ваулина Э.Н., Аникеева И.Д., Коган И.Г. Действие факторов внешней среды на одноклеточную зеленую водоросль -  хлореллу // Генетические последствия загрязнения окружающей среды. - М.: Наука.-1977.-С. 80-88.
Виленчик М.М. Радиобиологические эффекты и окружающая среда.- М.,1991.-160с.
Вострикова Т.В. Цитоэкология березы повислой. Автореф. дисс-.к.б.н.- Воронеж.-2000.
Генетические последствия загрязнения окружающей среды. Общие вопросы и методика исследования / Под ред. Н.П. Дубинина.-М.: Наука.-1977.-200с.
Глотов Н.В. и соавт. Эколого-генетическая изменчивость клевера белого в природных популяциях среднего приобья // Тз. Конференции ЇФундаментальные и прикладные проблемы охраны окружающей среды±.- Томск: ТГУ.-1995.-С.21.
Горовая А.И., Бобыль Л.Ф., Скворцова Т.В. и др. Методологические аспекты оценки мутагенного фона и генетического риска для человека и биоты от действия мутагенных экологических факторов // Цитология и генетика.-1996.-Т.30.-N6.-С.78-86.
Гриф В.Г., Иванов В.Б. Временные параметры митотического цикла у цветковых растений // Цитология.-1975.-Т. 17.- N.6.-С.694-717.
Гродзинский Д.Е. Радиобиология.-М.: Атомиздат.-1968.-231с.
Гундерина Л.С. Генетические последствия гамма-облучения Chironomus thummi и хромосомных аберраций в митотических клетках // Генетика.-1997.-N6-C.769-775.
Делоне Н.Л. Чувствительность разных фаз митоза и мейоза к ионизирующим излучениям // Итоги науки. Биологические науки 3. Ионизирующие излучения и наследственность.-М.: Наука.-1960.-С.155-175. 
Дмитриева С.А., Парфенов В.И. Кариология флоры как основа цитогенетического мониторинга: на примере Березовского биосферного заповедника.- Минск: Наука и техника.-1991.-231с.
Дубинин Н.П., Шевченко В.А. Мониторинг генетических процессов в природных популяциях, подвергающихся воздействию мутагенов // Критерии необходимых и достаточных тест-систем для идентификации потенциальных мутагенных и канцерогенных факторов в окружающей среде.-М.,1978.-С.4.
Дубинин Н.П., Алтухов Ю.П. Окружающая среда и генетический груз популяций // Успехи современной генетики.-1982.-Вып.10.-С.3.
Дубинин Н.П., Пашин Ю.В. Мутагенез и окружающая среда.- М.:Наука.-1977.-200с.
Дубинин Н.П. Новые подходы к изучению генетических процессов в населении людей, индуцированных мутагенами среды // Критерии необходимых и достаточных тест-систем для идентификации потенциальных мутагенных и канцерогенных факторов в окружающей среде.-М.,1978.-С.3.
Дубинин Н.П. и др. Генетические последствия действия ионизирующего  излучения на популяции // Мутагенез при действии физических факторов.- М.: Наука.- 1980.- С. 5-10.
Евгеньев М.И. Тест-методы и экология // Соросовский образовательный журнал.-1999.-N11.-С.29-34.
Зайнуллин В.Г. Генетические эффекты хронического облучения в малых дозах ионизирующего излучения.-СПб.: Наука.-1998.-100с.
Захаров В.М., Кларк Д.И. Биотест.-М., 1993.-68с.
Захаров И.А. Генетический анализ радиоустойчивости клеток и общие проблемы генетики // Цитология и генетика.-1970.-Т.4.-N2.-С.123-139.
Захаров И.С., Хантулева Л.А. Цикл лабораторных работ по курсу "Экология" с использованием биотестирования // Тезисы докладов 50-й Научно-технической конференции СПТУ телекоммуникаций, Спб., 20-24 янв. 1997.- Спб.-1997.-С.140-141.
Иванова О.А. Генетика.-М.:Колос.-1974.-431с.
Ивенс Х. Повреждение хромосом ионизирующими излучениями. М.: Атомиздат.-1966.-192 с. 
Ильинская О.Н., Иванченко О.Б., Карамова Н.С. Определение генотоксичности веществ в краткосрочных тест-системах // Методическое руководство. - КГУ,1995.-22с.
Ильинских Н.Н. и др. Мутагенные последствия радиационных загрязнений Сибири.-Томск: Изд-во СГМУ.-1995.-253с
Инге-Вечтомов С.Г. Экологическая генетика. Что это такое? // Соросовский образовательный журнал.-1998.-N2.-С.59-65.
Кавеленова Л.М. Использование биоиндикаторов в мониторинге: оценка влияния техногенных ксенобиотиков на растения // Тезисы конференции "Фундаментальные и прикладные проблемы охраны окружающей среды".Томск:ТГУ.-1995.-С.43.
Калаев В.Н. Цитогенетический мониторинг загрязнения окружающей среды с использованием растительных тест-объектов. Автореф. дисс-.к.б.н.- Воронеж.-2000.
Клекка У.Р. Дискриминантный анализ//Факторный, дискриминантный и кластерный анализ.-М.:Мир.-1982.-С.78-138.
Комарницкий Н.А., Кудряшов Л.В., Уранов А.А. Ботаника (Систематика растений).-М.: Просвещение.-1975.-608с.
Константинов А.В. Мейоз.-Минск: Изд-во БГУ.-1971.-180с.
Корытова А.И.  Мутации хромосом в зоне повышенного загрязнения атмосферы // Интродукция и экспериментальная экология растений.-Днепропетровск.-1983.-С. 86.
Корытова А.И., Михайлов  О.Ф., Яцук Н.А. Уровень мутаций  хромосом в  зависимости от загрязнения воздуха в цехах коксохимического завода // Интродукция и экспериментальная экологиярастений. - Днепропетровск: ДГУ.-1985.-С. 15-21.
Леонов В.П. Обработка экспериментальных данных на программируемых микрокалькуляторах.-Томск: Изд-во ТГУ.-1990.-375с.
Лучник Н.В. Биофизика цитогенетических поражений и генетический код. - .:Медицина. - 1968.-296с.
Магешвари П. Эмбриология покрытосеменных.-М.-1954.-С.216-225.
Мекшенков М.И. О сравнительной эффективности прямого и косвенного действия ионизирующей радиации на ДНК // Доклады АН СССР, 1962.-Т.142.- N4.-С. 944-947.
Меннинг У.Д.,Федер У.А. Биомониторинг загрязнения атмосферы с помощью растений.-Л.: Гидропромиздат., 1985.-175с.
Митрофанов Ю.А. Интродуцированная изменчивость хромосом эукариот.-М: Наука.-1994.-142 с.
Монахов А.С. Тестирование мутагенной и канцерогенной  активности химических и физических агентов на млекопитающих in vivo.-ВООГИС.-2000.-Т.2.-С.201-222.
Москвитина Н.С., Цитленок С.И., Бабенко А.С. Разработка комплексной системы для оценки окружающей среды // Фундаментальные и прикладные проблемы охраны окружающей среды.-ПООС-95: Материалы международной конференции, Томск, 12-16 сентября 1995 г.-Томск: Изд-во ТГУ.-1995.-С.83.
Оливернусова Л. Оценка состояния окружающей среды методом комплексной биоиндикации // Биоиндикация и мониторинг.-М: Наука.-1991.-С. 39-45.
Павулсоне С.А., Иорданский А.Б. Гилдилис В.И. Сравнительный морфометрический анализ хромосом Allium cepa L. // Генетика.- 1970.-Т.6.- N2.-С.40-55.
Паушева З.П. Практикум по цитологии растений.-М.: Агропромиздательство.- 1988.-271с.
Погосян В.С., Агаджанян Э.А., Хачатрян Н.К. Выявление генотоксических агентов производственных загрязнителей с использованием теста по А. cера // Биологический журнал Армении.-1987.-Т.40.-N6.-С.497-499.
Попова О.Н., Таскаев А.И., Фролова Н.П. Индикация радиоактивного загрязнения окружающей среды по его гаметоцидному действию // Радиобиология.-1991.-Т.31.- N2.-С.171-174. 
Пшеничнов Р.А., Пашин Ю.В., Захаров И.А. Современные тест-системы выявления мутагенов окржающей среды.-Свердловск: УрОАН.- 1990.-134 с.
Рапопорт И.А. Химический мутагенез. Теория и практика // Сельское хозяйство.-М.: Знание, 1966.-Т.17.- N5.-59 с.
Реутова Н.В., Шевченко В.А. О мутагенном влиянии двух различных соединений свинца // Генетика.-1991.-Т.27.- N7.- С. 1275-1279.
Ротт Н.Н. Клеточные  циклы в раннем эмбриогенезе пеляди // Онтогенез.-1979.-Т.10.-N3.-С 209-219.
Сергиевская Е.В.Практический курс систематики высших растений. - Л.: ЛГУ.-1991.-380с.
Смирнов Ю.А. Ускоренный метод исследования соматических хромосом плодовых //Цитология.-1968.-Т.10.-N12.-С 160.
Соколов Н.Н., Сидоров Б.Н. Современное состояние вопроса о механизме возникновения хромосомных перестроек // Современные проблемы радиационной генетики.- М.:Атомиздат.-1969.-С.79-91.
Турков В.Д. и др. Цитогенетический контроль в клеточной инженерии и экологическом мониторинге // Достижения науки и техники АПК.- 1990.- N8.- С.20-21.
Фонштейн Л.М., Шапиро А.А., Абилев С.К. Микроорганизмы как индикаторы мутагенной активности химических соединений и их метаболитов // Итоги науки и техники ВИНИТИ, сер. Биология.-1975.-N5.-690с.
Фонштейн Л.М., Абилев С.К., Бобринев Е.В. Методы первичного выявления генетической активности загрязнителей среды с помощью бактериальных тест-систем // Методические указания. - М.,1985.- 34с.
Худолей В.В. Характеристика современных мутагенных тестов для выявления канцерогенов окружающей среды / Успехи в современной биологии.-1984.- т.98.-вып.215.-С.177-192.
Худолей В.В. Возможность мутагенных тестов // Вопросы онкологии.- М.: Мир.-1983.-412с.
Цитленок С.И., Козлова А.А., Пулькина С.В. Цитогенетические изменения агропопуляций под влиянием антропогенной нагрузки // Устойчивое развитие: загрязнение окружающей среды и экологическая безопасность.- Днепропетровск.-1995.-С.11-12.
Цитленок С.И., Козлова А.А., Пулькина С.В., Абакумова Н.Н. Цитогенетический мониторинг A. cepa в агропопуляциях Томской области // Проблемы эволюционной цитогенетики, селекции и интродукции. Материалы научных чтений, посвященных 100-летию В.П. Чехова.-2-5 декабря 1997 г., г.Томск.
Цитленок С.И., Козлова А.А., Пулькина С.В., Дуброва Н. А. Оценка радиационного воздействия по цитогенетическому анализу лука // Радиоактивность и радиоактивные элементы в среде обитания человека. Материалы международной конференции.- Томск, 1996.-С.394-397.
Цитленок С.И., Козлова А.А., Пулькина С.В. Использование митотической активности как показателя антропогенной нагрузки в природных  и агропопуляциях растений. Материалы международной конференции.- Томск, 2002.
Шарма А. Химический мутагенез // Современные достижения молекулярной биологии хромосом и клеток.-Алма-Ата: Наука.-1989.-С.210-242.
Шевченко В.В. Закономерности распределения разрывов хромосом Crepis capillaris в разных типах аберраций при действии рентгеновских лучей и этиленимина // Радиобиология.-1964.-Т.4.-Вып.6.-С. 870-877. 
Шумный В.К. и др. Оценка последствий воздействий ядерных испытаний и других антропогенных загрязнений на растительные объекты // Генетические эффекты антропогенных факторов среды .-Новосибирск: ИЦиГ, 1993.-108с.
Яблоков А.В., Остроумов С.А. Уровни  охраны живой природы.- М .: Наука .- 1985.- 175 с 
Anderson P. Short-term tests detecting chemical mutagens and recommendations for their use in monitoring expoud population // Acad. Press.- 1979.- P. 383-405.
Barnes R., Jemes A.M., Jemieson G. The organization, nucleotide sequence and chromosomal distribution of a satelliteDNA from Allium cepa // Chromosoma.-1985.- Vol. 92.-P.185-192.
Beatty A.V, Beatty J. W. Chromosome breakage and rejoining in Tradescantia microspores //American Journal Botany.-1955.-V.40.-P.213-23.
Brat S. Ved.  Genetic system in Allium  I. chromosome variation // Chromosoma.-1965.- Vol. 16.-P.486-499.
Cortes F., Gonsales-Gill G., Lopes-Saez I.F.  Differental staining of  late replicating DNA-rich regions in  Allium cepa chromosomes // Caryologia.-1980.-Vol. 33.-P.193-202. 
Dixit G. B., Nerle S.K. Cytotoxic effects of industrial effluents on Allium cepa L. // Geobios (India).-1985.-Vol. 12.-N 6.-P. 237-240.
Fiskesjo G. Some  results from Allium tests with organic mercury halogenides // Hereditas.-1969.-V.62.-P.314-322.
Fiskesjo G. Chromosomal relationship between three species of Allium as revealed by C-banding // Hereditas.-1975.-Vol.81.-P.23-31.
Fiskesjo G. Benzoperyne and N-methyl-N-nitro-N-nirozoguanidine in the Allium test// Hereditas.-1981.-V.95.-P.155-162.
Fiskesjo G. The Allium test as a standard in environmental monitoring // Hereditas.-1985.-V.102.-P.99-112.
Fiskesjo G. The Allium test - an alternative in environmental studies: the relative toxicity of metal ions // Mutations Research.-1988.-V.197.-P.243-260.
Giles N.H., Beatty A.V. The effect of x-radiation in oxygen and hydrogen at normal and positive pressures on chromosome aberrations frequency in Tradeskantia microspores//Science.-1950.- Vol. 112.-P. 613-615.
Grant W.F. Chromosome aberrations in plants as a monitoring system // Environ., Health Perspect.- Vol. 27.-P. 37-43.
Holub Z., SchevchenkoV.A., Iota E. L. Environmental mutagens and carcerogenes // Biologia (CSR).-1986.-Vol. 41.-N7.-P. 705-714.
Levan A. Chemically induced chromosome reactions in Allium cepa and Vicia faba // Quant. Biology.- 1951.-Vol. 16.- P. 233-243.
Levan A. The effect of colchicine on root mitoses in Allium // Hereditas.-1987.-Vol. 24.-P. 471-486.
Nichols C. Spontaneous chromosome aberrations in Allium // Genetics.-1941.- Vol. 26.-P. 89.
Nilan R.A. Potential  of plant genetic systems for monitoring and screening mutagens // Environ. Health. Perspect.-1978.-V.27.- P. 181-196.
Perke D.V. Molecular mechanisms  of chemical toxicuty //Pol. J. Occup. Med.-1998.-.V.1.-P.18-38.
Sharma  A. Higher plants as  cytogenetic monitors for  chemical agents // J. Indian. Bot. Soc.-1985.- V.64.-N1.-P. 9-16.
Sobels T.N. Evaluating the mutagenic potential of chemicals.The minimal battery and extrapolation problems // Arch. Toxicol.-1980.-Vol. 46.-N12.-P.21-30.

23 примера оформления данных, их описания и описания целей исследования.

Примеры отличных диссертаций и статей по медицине и биологии, с нашими результатами статистического анализа

В.В. Половинкин.
ТОТАЛЬНАЯ МЕЗОРЕКТУМЭКТОМИЯ — ФАКТОР ПОВЫШЕНИЯ ЭФФЕКТИВНОСТИ ЛЕЧЕНИЯ СРЕДНЕАМПУЛЯРНОГО И НИЖНЕАМПУЛЯРНОГО РАКА ПРЯМОЙ КИШКИ.

Н.Г. Веселовская. 
КЛИНИЧЕСКОЕ И ПРОГНОСТИЧЕСКОЕ ЗНАЧЕНИЕ ЭПИКАРДИАЛЬНОГО ОЖИРЕНИЯ У ПАЦИЕНТОВ ВЫСОКОГО СЕРДЕЧНО-СОСУДИСТОГО РИСКА.

О.Я. Васильцева.
ЗАКОНОМЕРНОСТИ ВОЗНИКНОВЕНИЯ, КЛИНИЧЕСКОГО ТЕЧЕНИЯ И ИСХОДОВ ТРОМБОЭМБОЛИИ ЛЕГОЧНОЙ АРТЕРИИ ПО ДАННЫМ ГОСПИТАЛЬНОГО РЕГИСТРА ПАТОЛОГИИ.

В.А. Габышев. 
ФИТОПЛАНКТОН КРУПНЫХ РЕК ЯКУТИИ И СОПРЕДЕЛЬНЫХ ТЕРРИТОРИЙ ВОСТОЧНОЙ СИБИРИ.

М.И. Антоненко.
  ГИПЕРКОРТИЦИЗМ БЕЗ СПЕЦИФИЧЕСКИХ КЛИНИЧЕСКИХ СИМПТОМОВ: ЭПИДЕМИОЛОГИЯ, КЛИНИКА, ДИАГНОСТИКА.

Н.Г. Веселовская
ПРОГНОЗИРОВАНИЕ РИСКА РЕСТЕНОЗА КОРОНАРНЫХ АРТЕРИЙ ПОСЛЕ ИХ СТЕНТИРОВАНИЯ У ПАЦИЕНТОВ С ОЖИРЕНИЕМ


В. Леонов. Цели, возможности, и проблемы использования биостатистики в доказательной медицине. Доклад на Конференции по доказательной медицине в Ереване «От доказательной медицины к доказательному здравоохранению» (24 - 26 сентября 2015 года).

Фоторепортаж с Конференции по доказательной медицине в Ереване.

Фоторепортаж с семинара по биометрике в Ереване, прошедшего после конференции по доказательной медицине.

Отзывы слушателей семинара по биометрике в Ереване в сентябре 2015 г.


КУНСТКАМЕРА. Обзор большой коллекции медицинских статей и диссертаций с существенными ошибками и нелепыми использованиями и описаниями методов статистики.


Логистическая регрессия в медицине и биологии. Леонов В.

В серии из 9 статей рассмотрены основы метода логистической регрессии. Приведены многочисленные уравнения логистической регрессии и ROC-кривых, полученные при анализе реальных данных.

1. Логистическая регрессия. Основные понятия и возможности метода.
2. Логистическая регрессия. Анализ массивов большой размерности.
3. Логистическая регрессия. Примеры анализа реальных данных.
4. Логистическая регрессия и ROC-анализ.
5.Особенности логистической регрессии в акушерстве.
6.Особенности логистической регрессии в психиатрии, психологии и социологии.
7. Пример использования логистической регрессии для расчёта прогноза исхода оперативного лечения.
8. Логистическая регрессия  - "вершина пирамиды". А в "фундаменте" - что?
9. Как повысить качество логистической регрессии



Статистика в кардиологии. 15 лет спустя. Журнал "Медицинские технологии. Оценка и выбор", 2014, №1, с. 17-28. Леонов В.П.

Отзывы читателей обзора "Статистика в кардиологии. 15 лет спустя". В ноябре 2013 г. был опубликован наш обзор "Статистика в кардиологии. 15 лет спустя". За прошедшие полгода более 20 читателей этого обзора прислали нам свои отзывы по нему. Далее приведены фрагменты из двух отзывов, и наши комментарии к ним...


Статистика в кардиологии. 15 лет спустя. Журнал "Медицинские технологии. Оценка и выбор", 2014, №1, с. 17-28. Леонов В.П.

Отзывы читателей обзора "Статистика в кардиологии. 15 лет спустя". В ноябре 2013 г. был опубликован наш обзор "Статистика в кардиологии. 15 лет спустя". За прошедшие полгода более 20 читателей этого обзора прислали нам свои отзывы по нему. Далее приведены фрагменты из двух отзывов, и наши комментарии к ним...

ВАК для учёных? или ВАК для… бумагомарак? «ТРОИЦКИЙ ВАРИАНТ» № 8 (127), 2013 год. За 2 года, прошедших с момента публикации этой статьи, её прочитали более 29 тысяч читателей.  "Плагиат, обнаруживаемый в диссертациях, это «пена» диссертационного бизнеса. Поскольку в производстве диссертаций «под заказ» гораздо легче просто копировать фрагменты одних диссертаций, вставляя их в очередные заказные диссертации. Производители такого «товара» фабрикуют не только диссертации, но и массу журнальных статей. Основные причины появления этого бизнеса описал профессор Е.В. Балацкий ещё в 2005 г. [1-2], изложив и сценарии его ликвидации. Одной из ключевых причин рождения этого бизнеса являются изменения в Положениях ВАК".

Вузы РФ будут обязаны публиковать дипломы в электронных библиотеках

Диссертационные войны. Как борьба с плагиатом в диссертациях переместилась из науки в политику

Балацкий Е.В. Диссертационная ловушка


Интересная ссылка

В. Леонов. Цели, возможности, и проблемы использования биостатистики в доказательной медицине. Доклад на Конференции по доказательной медицине в Ереване «От доказательной медицины к доказательному здравоохранению» (24 - 26 сентября 2015 года).

Фоторепортаж с Конференции по доказательной медицине в Ереване.

Фоторепортаж с семинара по биометрике в Ереване, прошедшего после конференции по доказательной медицине (24 - 26 сентября 2015 года).

Отзывы слушателей семинара по биометрике в Ереване в сентябре 2015 г.

Вот к чему приводит безграмотное использование статистики в диссертациях: Приказы Минобрнауки России о снятии диссертации с рассмотрения


Логистическая регрессия в медицине и биологии
1. Логистическая регрессия. Основные понятия и возможности метода.
2. Логистическая регрессия. Анализ массивов большой размерности.
3. Логистическая регрессия. Примеры анализа реальных данных.
4. Логистическая регрессия и ROC-анализ.
5.Особенности логистической регрессии в акушерстве.
6.Особенности логистической регрессии в психиатрии, психологии и социологии.
7. Пример использования логистической регрессии для расчёта прогноза исхода оперативного лечения.
8. Логистическая регрессия  - "вершина пирамиды". А в "фундаменте" - что?
9. Как повысить качество логистической регрессии.


Камчатская биометрика-2014. Семинар по биометрике в камчатском НИИ КамчатНИРО. (24.03.2014-3.04.2014).

Камчатская фото-биометрика-2014. Фоторепортаж с семинара по биометрике в Петропавловске-Камчатском.

Отзывы слушателей семинара по биометрике в Петропавловске-Камчатском


ОТЗЫВ врача-кардиолога М.В. Емельяненко, ФКУ «Центральный военный госпиталь имени П.В. Мандрыка» МО РФ, Москва, о проведённом статистическом анализе.  Хочу выразить глубокую признательность за качественный и весьма объёмный труд, проделанный Вами по статистическому анализу моей базы данных. Особенную благодарность, без сомнения, хотелось бы выразить руководителю проекта «БИОМЕТРИКА» - Василию Петровичу Леонову. Причина такой благодарности следующая. Помимо структурированного статистического анализа присланных в Ваш адрес медицинских данных, Вы подробно и, что самое невероятное,  – доступным образом разъяснили мне суть каждого метода, который был применён при анализе моей матрицы. (далее...)

ОТЗЫВ Ахметова А., (Казахстан), о сотрудничестве с БИОМЕТРИКОЙ. Когда я взялся за написание диссертации, то вначале я пытался самостоятельно выполнить статистический анализ собранных мною данных. Для этого пробовал использовать EXCEL и STATISTICA. Однако по мере расширения набора используемых методов анализа, всё яснее стал осознавать, что я не понимаю как сами методы, так и получаемые результаты. Чтобы лучше в этом разобраться, стал очень часто посещать сайт БИОМЕТРИКА. Иногда ежедневно по 2-3 часа читал на этом сайте разные статьи. Особенно полезными были обзоры по Кузбассу, по кардиологии, а также статья "Долгое прощание с лысенковщиной". (далее...)"

Новые полезные книги...

Ланг Т., Сесик М. Как описывать статистику в медицине. Руководство для авторов, редакторов и рецензентов. Пер. с англ. В.П. Леонова. 2016 - 480 с. Актуальность этого издания весьма велика. По-прежнему в биомедицинских статьях и диссертациях публикуется масса статистических нелепостей, как образцы "статистического самоудовлетворения" и "статистического макияжа". Например, в двух диссертациях, выполненных в 2014 и 2015 гг. в Алтайском медуниверситете по разным специальностям, но при этом в полностью идентичных описаниях, состоящих из 94 слов, написано следующее. «Полученные данные были статистически обработаны с использованием программ Microsoft Offis Exel 2007. Достоверность различий между средними величинами определяли с помощью критерия значимости Стьюдента (t). Нормальность распределений в группах оценивали по критерию Шапиро-Уилка». Далее сообщается об использовании критерия Манна-Уитни, и т.д. Очевидно, что под Offis Exel авторы подразумевали Office Excel. Сложнее было бы об этом догадаться, если бы авторы написали Offis Exul. Вывод: оба диссертанта, как и члены двух диссертационных советов, не знают многого, в том числе описанного в этой книге. Например, не знают того, что в пакете Office Excel нет критериев Шапиро-Уилка и Манна-Уитни. Данная книга обучит правильно и хорошо описывать и понимать результаты статистического анализа. Поэтому исследователи станут более качественно выполнять статистический анализ, получая правильную технологию лечения пациентов. Что в результате будет снижать смертность населения, а также себестоимость лечебных процедур.

Петри А., Сэбин К. Наглядная медицинская статистика. Учебное пособие. 3-е издание. Пер. с англ. В.П. Леонова. 2015. - 216 с.
Предыдущие издания оригинала этой книги были опубликованы в 2000, 2005 и 2009 гг. Третье издание книги, как и два предыдущих, имеет целью донести до читателя основные понятия и принципы медицинской статистики, которые достаточно широко используются зарубежными медиками и биологами. Книга содержит необходимую теоретическую часть, а также в доступной форме даёт практическое описание того, как могут применяться статистические методы в реальных клинических исследованиях. Низкий уровень использования статистики в отечественной медицинской науке является одной из основных причин, по которым уже 111 лет Нобелевские премии по медицине не присуждаются россиянам. Ценность этой книги для медицинской науки определяется и проводимой в России реформой отечественной науки, в том числе реформой ВАК и системы научной аттестации. Учебное пособие предназначено для студентов, аспирантов и докторантов медицинских вузов, биологических факультетов университетов, врачей, исследователей-клиницистов и всех, кто является сторонником доказательной медицины.

Банержи А. Медицинская статистика понятным языком: вводный курс. Издательство "Практическая медицина", 2014. - 287 с. Пер. с англ. В.П. Леонова.
Издание представляет собой вводный курс по принципам статистики. Представлены базовые понятия и принципы статистических исследований применительно к медицине. В отличие от большинства подобных изданий, указанные темы изложены кратко и доступно. Для чтения книги не требуется знание сложных разделов высшей математики, вполне достаточно тех, что даются в школе. Внедрение в практику принципов доказательной медицины диктует необходимость понимания статистики. После знакомства с книгой читатель сможет критически оценивать многочисленные публикации, содержащие статистическую терминологию и результаты описанных исследований. Полученные знания помогут избежать ошибок в планировании биомедицинских исследований, а также в изложении их результатов. Большим преимуществом книги служат глоссарий и подробный предметный указатель.
Для студентов, аспирантов, научных работников, а также врачей всех специальностей.

Т. Гринхальх. Основы доказательной медицины. Издательство "ГЭОТАР-Медиа", 2015. - 336 с. 4-е издание переработанное и дополненное. Пер. с англ. Под ред. И.Н. Денисова, К.И. Сайткулова, В.П. Леонова.
Данная книга является наиболее популярным в мире руководством по доказательной медицине, ставшее известным и в России. Руководство предназначено для студентов и врачей. За 18 лет с момента первого издания в 1996 г., эта книга переведена на восемь языков (испанский, итальянский, китайский, немецкий, русский, французский, чешский, японский) и напечатана огромными тиражами. Руководство завоевало признание практикующих врачей, преподавателей и студентов во многих странах; по нему преподается медицина, основанная на доказательствах, в медицинских школах всего мира. В книге 17 глав, среди которых есть и глава "Статистика для неспециалиста". Эта главу мы дополнили большим списком русскоязычной литературы как по самой статистике, так и по биостатистике. А начинается книга с определения понятия "доказательная медицина". Итак, что же такое "доказательная медицина"?
Что, чем, и зачем "доказывают"? Читайте эту книгу!


RusDASL - российская библиотека данных  для изучающих биометрику и биостатистику. DASL (The Data and Story Library ) - под такой аббревиатурой на веб-сайте Carnegie Mellon University размещена известная библиотека исходных статистических данных данных из различных отраслей науки. Теперь аналогичная библиотека открыта на БИОМЕТРИКЕ и для российских пользователей.
Кунсткамера
Один из моих коллег по университету долгое время собирал коллекцию под названием "Бредотека". В ней он коллекционировал разнообразные примеры бредовых идей, сообщений и высказываний. Другие собирают аналогичные коллекции под названием "Абсурдотека". Свою коллекцию образцов статистической некорректности, а подчас и невежества, мы решили назвать "Кунсткамера".
Открыт зал экспонатов журнала "Бюллетень экспериментальной биологии и медицины". Подведены итоги конкурса на эпиграфы к этому разделу



Новый экспонат КУНСТКАМЕРЫ: Диссертация Порываевой О.В., Барнаул, 2004 г. "...Полагаю, что отмеченных выше недостатков уже более чем достаточно, чтобы обратиться в ВАК РФ с предложением о повторном изучениии данной работы в экспертном совете ВАК. Обновление раздела КУНСТКАМЕРА - диссертации "Содержание микронутриентов у школьников г. Сургута", "Организационно-методические условия оздоровительных занятий студенток специальной медицинской группы с диагнозом нейроциркуляторная дистония", Сургутский государственный университет.

Новый экспонат КУНСTКАМЕРЫ - Диссертация «Анализ полиморфизма генов сердечно-сосудистой системы и системы детоксикации в различных возрастных группах Санкт-Петербурга». Обсуждаемая диссертация являет собой ярчайший пример того, какую злую шутку может сыграть с автором игнорирование проблемы множественных сравнений при статистическом анализе полученных данных.

Новый экспонат КУНСTКАМЕРЫ
- Диссертация "Оценка проаритмических факторов при постинфарктной систолической дисфункции миокарда и эффективности их фармакологической коррекции", Кемеровская государственная медицинская академия, Кемерово - 2004 г.

Новый экспонат КУНСTКАМЕРЫ
- Диссертация "Сравнительная характеристика показателей кардиореспираторной системы спортсменов и лиц, не занимающихся спортом, в условиях северного промышленного города", Тюменский государственный университет, Тюмень - 2006 г
.

 


 Музыка для души ...

 

 

 

1997 - 2017.© Василий Леонов. E-mail:

Доказательная или сомнительная? Медицинская наука Кузбасса: статистические аспекты.

Отклики читателей статьи "Доказательная или сомнительная?"

Возврат на главную страницу.

Возврат в КУНСТКАМЕРУ

Т. Кун "Структура научных революций"