Яндекс.Метрика

Ошибки статистики в медицине

Каждый слышит то, что понимает. Гете


"Люди перестают мыслить,
когда перестают читать
". Д. Дидро

Статистика посещаемости БИОМЕТРИКИ Яндекс
цитирования
Индекс цитирования

Наш адрес:

Выбрав любое изображение, кликните по нему мышкой, и Вы узнаете о статистике ...


Редактор БИОМЕТРИКИ
В. Леонов

  • 385
data-counter data-url="http://www.biometrica.tomsk.ru/">
Яндекс
цитирования
Яндекс цитирования
 

16.05.2011 г. на сайт пришло 2561 человек, открывших 3205 страниц
14.11.2011 г. на сайт пришло 2106 человек, открывших 3250 страниц
14.12.2011 г. на сайт пришло 2640 человек, открывших 3452 страницы
17.01.2012 г. на сайт пришло 2439 человек, открывших 3097 страниц
03.03.2012 г. на сайт пришло 2219 человек, открывших 3019 страниц
30.05.2012 г. на сайт пришло 3512 человек, открывших 4706 страниц
06.03.2014 г. на сайт пришло 2556 человек, открывших 3179 страниц
08.02.2015 г. на сайт пришло 2341 человек, открывших 2682 страницы

Если приходят, значит полезное находят...


Введение
Наши возможности. О возможностях статистического анализа
Леонов В.П. Ошибки статистического анализа биомедицинских данных. Международный журнал  медицинской практики, 2007, вып. 2, стр.19-35
Список научных и учебных изданий по биометрике и статистике
Материалы по науковедению
История биометрики
Статистическое рецензирование статей и диссертаций

Долгое прощание с лысенковщиной...
Семинар по биометрике в Красноярске



Если Вы сторонник использования
статистики, разместите на своём сайте
HTML-код нашего баннера:

BIOMETRICA - журнал для сторонников доказательной биологии и медицины
25 наиболее популярных ссылок, посещаемых нашими читателями
http://www.biometrica.tomsk.ru/comp_aver.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/erevan_8.html
http://www.biometrica.tomsk.ru/student.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/UNESCO%202010.pdf
http://www.biometrica.tomsk.ru/zakaz.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/zakaz_28.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/kk.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/erevan_3.html
http://www.biometrica.tomsk.ru/stat_cardio1.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/error.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/STAT_CARDIO_2014.pdf
http://www.biometrica.tomsk.ru/logit_9.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/stat_cardio7.htm

http://www.biometrica.tomsk.ru/potencial.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/percent_00.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/lis.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/kamchat.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/biometrica_15.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/zakaz_15.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/ftp/dict/cult/gramm.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/biometrica_15.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/stat_cardio5.htm
http://www.biometrica.tomsk.ru/krasnojarsk.htm http://www.biometrica.tomsk.ru/erevan_3.html
http://www.biometrica.tomsk.ru/logit_6.htm

БИОМЕТРИКА + Музыка. В. Леонов.

Музыка... Вот что сказал о ней великий Иоганн Себастьян Бах: "Цель музыки - трогать сердца". В детстве автор этих строк получил музыкальное образование. Любимыми инструментами были мандолина и гитара. Любимыми композиторами - Вивальди, Бах, Альбиони, Боккерини, Беллини, Корелли, Скарлатти. В 80-е годы прошлого столетия в Томск часто приезжал с концертами маэстро Владимир Спиваков. Эти концерты организовывал Егор Лигачёв, бывший в ту пору первым секретарём Томского обкома КПСС. На свой первый концерт в Томск Владимир Спиваков приехал один. Великолепно играл на скрипке! Концертный зал был переполнен слушателями, которые были в восторге от его концерта. Именно тогда мне удалось впервые встретиться с ним, и взять у него автографы на его грампластинки. В дальнейшем посещал все его концерты. В 1979 г. В. Спиваков организовал камерный оркестр "Виртуозы Москвы". Однажды в 90-е годы Владимир Спиваков должен был приехать в Томск с "Виртуозами Москвы", и в течение трёх дней дать 3 концерта. Однако из-за проблем с топливом в те времена, их самолёт посадили в Омске, где они пробыли 2 дня. И когда прилетели в Томск, то в один день провели все 3 концерта, которые я прослушал. И вновь взял автографы на новые грампластинки, и сделал много фотографий В. Спивакова.


Музыка...  Она помогает всегда. Вот почему я рассылаю почти всем своим корреспондентам файлы с хорошей музыкой. Любите музыку, слушайте её чаще. И она поможет лучше понимать бистатистику и результаты статистического анализа...

13 февраля 2014 г. Владимир Спиваков и "Виртуозы Москвы" дали концерт в Краснодаре. Я посетил этот прекрасный концерт, и вновь встретился с Владимиром Теодоровичем. Подарил ему его грампластики, фотографии, и свою книгу.

НАУКОМЕТРИКА СТАТИСТИЧЕСКОЙ ПАРАДИГМЫ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНОЙ БИОМЕДИЦИНЫ   (ПО МАТЕРИАЛАМ ПУБЛИКАЦИЙ). В.П.Леонов. Самая читаемая наша статья после отправки в мае м-це 2017 г. более 300 писем авторам статей мед. журналов о наличии в них примитивных и ошибочных методов статистического анализа, и получаемых при этом результатах...

Ошибки статистического анализа биомедицинских данных

 Леонов В.П.

Международный журнал 
медицинской практики,
2007, вып. 2, стр.19-35
.

В статье рассмотрено много примеров ошибочного использования статистики в российской биологии и медицине. Дана классификация основных видов ошибок, обсуждаются обзоры по этой теме за предыдущие 50 лет. Дана классификация причин возникновения таких ошибок в биологии и медицине. С позиций меметики рассмотрены более 1500 статей, монографий и диссертаций, содержащих  типичные ошибки использования и описания статистики. Приведены цепочки мемов с ошибочными описаниями методов сравнения средних и статистической значимости результатов и доверительной вероятности.

Показано существование устойчивых мемов ошибочного описания статистики внутри отдельных научных школ, например в Сибирском государственном медицинском университете. Вводится новый тип мема - мем камуфляжного описания, используемый для маскировки неправильного применения статистики в медицинском исследовании. Установлено, что наиболее часто встречаются случаи ошибочного использования t-критерия Стьюдента, без необходимой проверки обязательных для этого условий. Наиболее часто подобные ошибки встречаются в публикациях журнала "Бюллетень экспериментальной биологии и медицины". 

Достаточно часто в российских публикациях приводятся описания некорректного применения многомерных статистических методов, таких как факторный и кластерный анализ. На основе анализа причин живучести таких ошибок в биомедицине, даны конкретные рекомендации по разрешению этой проблемы. Основным средством для этого является создание в медицинских исследовательских организациях лабораторий биостатистики.


Оглавление

Ошибка – это …

Ошибка или обман?

Обзоры ошибок применения статистики в медицине

Причины возникновения ошибок и меры борьбы с ними

Ошибки описания статистических методов

Меметический анализ описаний методов статистики

Локализация ошибочных описаний внутри научных школ

Мемы камуфляжных описаний

Смутно пишут о том, о чём смутно представляют

Коварный t-критерий Стьюдента

«… не зная законов языка ирокезского, можешь ли ты делать такое суждение  по  сему предмету…»

Что же делать, чтобы избежать ошибок?


 

Локализация ошибочных описаний внутри научных школ

Дилетант обнаруживает себя прежде

всего незнанием терминологии.

Г. Селье.

 

   Описания, приведенные в следующих 2 кандидатских и 3 докторских диссертациях представляют особый интерес. Четыре из них относятся к одной и той же научной специальности 14.00.17 – нормальная физиология, а 5-я диссертация защищена по близкой специальности 14.00.16 – патологическая физиология.

   Интересно и то, что один и тот же человек выступает в роли научного руководителя в кандидатских диссертациях и в роли научного консультанта в докторских диссертациях. Автор же 8-й докторской диссертации выступает в качестве научного руководителя в кандидатской диссертации 7. Все эти факты позволяют говорить о принадлежности диссертантов к одной научной школе. Эти работы достаточно близки по:

  1. срокам выполнения работ: - 1992г., 1993г, 1994г. и 1995г;
  2. содержанию исследования и месту выполнения;
  3. структуре названия работ - в трех диссертациях одно и то же первое слово, а в двух диссертациях полностью совпадают первые четыре слова.{4905, 4935, 4936, 1937}

диссертации 7 (стр.35)

диссертации 8 (стр.49)

диссертации 9 (стр.39)

диссертации 10 (стр.59)

диссертации 11 (стр.68)

Достоверным считали отличия с уровнем доверительной вероятности

p < 0,05

Достоверными считались отличия с уровнем доверительной вероятности

p < 0,05

Достоверными считались отличия с уровнем доверительной вероятности

p < 0,05

Достоверными считались отличия с уровнем доверительной вероятности

p < 0,05

Достоверными считали различия с уровнем доверительной вероятности

p < 0,05

Все это позволяет сделать вывод о том, что в этой научной школе прочно закрепились и культивируются ошибочное понимание и описание самого смысла доверительной вероятности! Приведем несколько цитат касающихся смысла доверительной вероятности, и далее сравним их с анализируемым ошибочным мемом. Жирным шрифтом выделим ту часть цитат, которая будет наиболее важна для нашего анализа.

  1. «Доверительная вероятность – вероятность того, что оцениваемый вектор характеристики (параметров) совокупности генеральной накрывается доверительной областью (доверительным интервалом – оценкой интервальной при одном параметре). Доверительная вероятность должна быть достаточно большой, т.е. отвечать принципу практической достоверности. Другие названия: надежность доверительной области, доверительный коэффициент». {Статистический словарь. М.: Финансы и статистика, 1989, - 623 с.} (с. 117-118).
  1. «А теперь рассмотрим интервальные оценки, т.е. возможность, исходя из выборочных значений x 1, x2, … xn, построения некоторого интервала, содержащего истинное значение параметра µ с заданной вероятностью. Метод получения таких интервалов сводится к построению нижнего и верхнего доверительных пределов µн и µв н и µ в есть функции от выборочных значений), и если мы говорим, что истинное значение параметра лежит между этими доверительными пределами, то это утверждение выполняется с вероятностью (1 - α) и не выполняется с вероятностью α (число (1 – α) называется доверительным уровнем). Следовательно, выбрав достаточно малое число (обычно в биологических задачах 0,05 или 0,01), мы по выборочным значениям x1, x2, … xn, построим доверительный интервал (µн, µв), соответствующий доверительному уровню 1 – α.  Обычно строят так называемые центральные доверительные интервалы. Очень часто, когда доверительный уровень измеряется в процентах, применяется термин 100 (1– α)%-ный интервал (например, 95%-ный доверительный интервал confidence interval, если 1 – α = 0,95)». {Компьютерная биометрика/Под ред. В.Н.Носова.М.: Изд-во МГУ, с. 232} (с. 44). 
  1. «В этом параграфе мы рассмотрим вопрос получения интервальных оценок, т.е. возможность построения некоторого интервала, содержащего истинное значение параметра с заданной точностью. Сам метод получения таких интервалов сводится к построению так называемых доверительных пределов, а полученные интервалы называются доверительными. Процедура, которую мы собираемся описать в этом параграфе, состоит в построении нижнего и верхнего доверительных пределов  уровня (1 - α), обладающих следующим свойством: если мы говорим, что истинное значение параметра лежит между этими пределами, то это утверждение верно с вероятностью 1 – α (и неверно с вероятностью α). Очевидно, что «α» следует выбирать достаточно малым (обычно используемые значения равны 0,05 и 0,01). Число 1 – α называют коэффициентом доверия или доверительной вероятностью».{Браунли К.А. Статистическая теория и методология в науке и технике, М.: Наука, с. 407}(с. 114). 
  1. Закончим этот экскурс в описание понятия доверительной вероятности часто цитируемым в биомедицинских публикациях учебным пособием Г.Ф. Лакина {Лакин Г.Ф. Биометрия. М.: Высшая школа, с. 352} (с. 106. «Вероятности, признанные достаточными для уверенного суждения о генеральных параметрах на основании известных выборочных показателей, называют доверительными вероятностями. Понятие о доверительных вероятностях предложено Р.Фишером. Оно вытекает из принципа, который положен в основу применения теории вероятностей к решению практических задач. Согласно этому принципу, маловероятные события считают практически невозможными, а события, вероятность которых близка к единице, принимают за почти достоверные. Обычно в качестве доверительных используют вероятности Р1 = 0,95; Р2 = 0,99; Р3 = 0,999».

Итак, основной вывод, который делается во всех этих цитатах, заключается в том, что величина доверительной вероятности, т.е. степени нашей уверенности в декларируемых утверждениях, должна быть достаточно близка к 1. В противном же случае, если эта величина близка к нулю, теряется ее смысл как степени уверенности, доверия к этим утверждениям. Таким образом, 5 авторов использовавших приведенный выше ошибочный мем, утверждали, что степень их уверенности в своих выводах не более 5%! Наличие подобного растиражированного ошибочного мема в нескольких защищенных диссертациях означает, что это абсурдное утверждение не смутило ни руководителей и консультантов этих диссертаций, ни представителей ведущих организаций, ни оппонентов, ни рецензентов, ни членов экспертных советов  ВАК РФ. Таким образом, научная среда, где циркулирует данный ошибочный мем, гораздо шире, нежели коллектив данных авторов.  Напомним, что эти утверждения приведены не в дипломных работах выпускников вуза, а в квалификационных работах на ученые степени кандидатов и докторов медицинских и биологических наук, авторы которых уже имели не одну печатную публикацию, а некоторые из них уже годами читают лекции студентам. Поэтому сомнительно, что приведенные мемы есть результат неточного изложения авторами своих мыслей. Скорее наоборот, что данные мемы и есть адекватное отображение устоявшегося в данной научной школе и вузе абсолютно искаженного представления о доверительной вероятности. Поскольку содержание данного ошибочного описания «одобрено» многими официальными уровнями (ведущая организация, диссертационный совет, экспертный совет ВАК, президиум ВАК РФ), то понятно, что и последующие исследователи, читая эти диссертации и слушая лекции этих преподавателей,  будут инфицированы этими же мемами, которые вновь будут реплицироваться уже в их статьях и диссертациях.

Литература

Диссертация 7.Диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук "Роль поджелудочной железы в регуляции антитрипсиновой и трипсиновой активности крови." Диссертант - Афанасьева А.Н., специальность 14.00.17 - нормальная физиология. Сибирский государственный медицинский университет, Томск - 1990 г.

Диссертация 8. Диссертация на соискание ученой степени доктора биологических наук "Роль трипсина в регуляции моторной функции тонкой кишки." Диссертант - Васильев В.Н., специальность  14.00.17 -нормальная фиизиология. Сибирский государственный медицинский университет, Томск - 1992 г.

Диссертации  9. Диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук "Роль поджелудочной железы в регуляции антитрипсиновой и трипсиновой активности крови."  Диссертант - Афанасьева А.Н., специальность 14.00.17 - нормальная физиология. Сибирский государственный медицинский университет, Томск - 1990 г.

Диссертация 10. Диссертация на соискание ученой степени доктора медицинских наук "Функционирование калликреин-кининовой системы крови в норме и при патологии."  Диссертант - Шумилов С.П., специальность  14.00.16 - пат. Физиология, 14.00.17 - нормальная физиология.  Сибирский государственный медицинский университет, Томск - 1995 г.

Диссертация 11. Диссертация на соискание ученой степени доктора биологических наук "Механизмы образования и деградации надэпителиального слизистого слоя пищеварительного тракта." Диссертант - Кривова Н.А., специальность 14.00.17 - нормальная физиология. НИИ биологии и биофизики Томского государственного университета,Томск - 1994 г.

Центр БИОСТАТИСТИКА выполняет работы по статистическому анализу экспериментальных данных уже более 30 лет. В его составе исследователи России, США, Израиля, Англии, Канады и других стран. Услугами Центра пользуются аспиранты и докторанты в области медицины, биологии, социологии, психологии и т.д. (См. далее )

Отзывы заказчиков по статистическому анализу данных

СТАТИСТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ДАННЫХ ДЛЯ МЕДИКОВ И БИОЛОГОВ (время и опыт).
Леонов В.


Очередной отзыв о нашем сотрудничестве Гарт В.А., аспиранта кафедры техносферной безопасности НИТУ “МИСиС”.


Сравниваем средние, а также и ... В. Леонов

     Исследователям в медицине и биологии весьма большую пользу приносит сравнение не только групповых средних, но также и иных параметров. Такими новыми сравнениями являются проверки равенства дисперсий, коэффициентов корреляции, коэффициентов регрессии или векторов групповых средних, сравнение групп многомерными методами, и т.д. В статье объяснена большая ценность обнаружения не нормального распределения признака. Показано, что не нормальное распределение количественного признака, означает наличие взаимосвязей данного признака с другими признаками. Что является важнейшим аргументом по формулировке списка проверки взаимосвязей важнейших признаков проводимого исследования. Специфика других сравнений хорошо иллюстрируется различными графиками, а также наличием списка литературы из 98 книг и статей, полезных для этой тематики. Причём более половины из них имеют ссылки на доступные в интернете данные издания. По традиции очередной годовщины нашего сайта, в две последние статьи размещены ещё и иные весьма полезные ссылки..


Проценты - статистический анализ? Или проценты - арифметический анализ? В. Леонов.


23 примера оформления данных, их описания и описания целей исследования


В ноябре 2013 года сайту БИОМЕТРИКА исполнилось 16 лет. А что было раньше? И что теперь?


Примеры отличных диссертаций и статей по медицине и биологии, с нашими результатами статистического анализа

В.В. Половинкин
ТОТАЛЬНАЯ МЕЗОРЕКТУМЭКТОМИЯ — ФАКТОР ПОВЫШЕНИЯ ЭФФЕКТИВНОСТИ ЛЕЧЕНИЯ СРЕДНЕАМПУЛЯРНОГО И НИЖНЕАМПУЛЯРНОГО РАКА ПРЯМОЙ КИШКИ.

Н.Г. Веселовская 
КЛИНИЧЕСКОЕ И ПРОГНОСТИЧЕСКОЕ ЗНАЧЕНИЕ ЭПИКАРДИАЛЬНОГО ОЖИРЕНИЯ У ПАЦИЕНТОВ ВЫСОКОГО СЕРДЕЧНО-СОСУДИСТОГО РИСКА.

О.Я. Васильцева ЗАКОНОМЕРНОСТИ ВОЗНИКНОВЕНИЯ, КЛИНИЧЕСКОГО ТЕЧЕНИЯ И ИСХОДОВ ТРОМБОЭМБОЛИИ ЛЕГОЧНОЙ АРТЕРИИ ПО ДАННЫМ ГОСПИТАЛЬНОГО РЕГИСТРА ПАТОЛОГИИ.

В.А. Габышев  ФИТОПЛАНКТОН КРУПНЫХ РЕК ЯКУТИИ И СОПРЕДЕЛЬНЫХ ТЕРРИТОРИЙ ВОСТОЧНОЙ СИБИРИ.

М.И. Антоненко
  ГИПЕРКОРТИЦИЗМ БЕЗ СПЕЦИФИЧЕСКИХ КЛИНИЧЕСКИХ СИМПТОМОВ: ЭПИДЕМИОЛОГИЯ, КЛИНИКА, ДИАГНОСТИКА.

Н.Г. Веселовская"ПРОГНОЗИРОВАНИЕ РИСКА РЕСТЕНОЗА КОРОНАРНЫХ АРТЕРИЙ ПОСЛЕ ИХ СТЕНТИРОВАНИЯ У ПАЦИЕНТОВ С ОЖИРЕНИЕМ"

И.А. Бирюкова Научно - практическая работа " ФАРМАКОЭКОНОМИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ РОЗНИЧНОГО РЫНКА ГОРОДА ОМСКА"

А.Г. Сыркина Ретроспективный анализ эффективности и безопасности тромболитической терапии острого инфаркта миокарда у больных пожилого и старческого возраста (диссертация на соискание учёной степени кандидата медицинских наук).

В. Леонов. Цели, возможности, и проблемы использования биостатистики в доказательной медицине. Доклад на Конференции по доказательной медицине в Ереване «От доказательной медицины к доказательному здравоохранению» (24 - 26 сентября 2015 года).

Фоторепортаж с семинара по биометрике в Ереване, прошедшего после конференции по доказательной медицине (24 - 26 сентября 2015 года).

Отзывы слушателей семинара по биометрике в Ереване в сентябре 2015 г.


Камчатская биометрика-2014. Семинар по биометрике в камчатском НИИ КамчатНИРО. (24.03.2014 - 3.04.2014).

Камчатская фото-биометрика-2014. Фоторепортаж с семинара по биометрике в Петропавловске-Камчатском.

Отзывы слушателей семинара по биометрике в Петропавловске-Камчатском


RusDASL - российская библиотека данных  для изучающих биометрику и биостатистику. DASL (The Data and Story Library ) - под такой аббревиатурой на веб-сайте Carnegie Mellon University размещена известная библиотека исходных статистических данных данных из различных отраслей науки. Теперь аналогичная библиотека открыта на БИОМЕТРИКЕ и для российских пользователей...

 

 


1997 - 2018.© Василий Леонов. E-mail:

Доказательная или сомнительная? Медицинская наука Кузбасса: статистические аспекты.

Отклики читателей статьи "Доказательная или сомнительная?"

Возврат на главную страницу.

Возврат в КУНСТКАМЕРУ

Т. Кун "Структура научных революций"